22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0672 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0672  hypothetical protein  100 
 
 		 60 aa  124  6e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.482572 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0263  protein CoxF  54.35 
 
 		 50 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.120067  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3456  conserved protein CoxF  48.33 
 
 		 54 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0727  protein CoxF  50 
 
 		 55 aa  53.9  0.0000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.076153 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0605  hypothetical protein  55 
 
 		 46 aa  53.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0645  hypothetical protein  58.97 
 
 		 46 aa  52.4  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.164541 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0030  protein CoxF  53.49 
 
 		 54 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.148285  normal  0.786254 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3584  protein CoxF  43.33 
 
 		 54 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3260  protein CoxF  43.33 
 
 		 54 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0873642 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0521  hypothetical protein  52.38 
 
 		 46 aa  48.5  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.688075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0258  CoxF protein  56.82 
 
 		 54 aa  48.1  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.962663  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3460  CoxF protein  56.82 
 
 		 54 aa  48.1  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.548506  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1043  hypothetical protein  55.26 
 
 		 45 aa  45.8  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0902  CoxF protein  52.27 
 
 		 55 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0674992  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0764  CoxF protein  41.67 
 
 		 56 aa  44.7  0.0005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.272671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0226  CoxF protein  41.67 
 
 		 56 aa  44.7  0.0005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2231  hypothetical protein  48.72 
 
 		 65 aa  43.1  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0775503  hitchhiker  0.0077658 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4645  protein CoxF  70.45 
 
 		 61 aa  42  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0853547  normal  0.0948829 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4790  putative CoxF  50 
 
 		 59 aa  41.6  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4503  hypothetical protein  40 
 
 		 54 aa  41.2  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.740711  normal  0.327567 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2346  protein CoxF  58.7 
 
 		 50 aa  40.8  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0744  hypothetical protein  46.34 
 
 		 52 aa  40.4  0.008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0200822  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>