13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_0341 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008701  Pisl_0341  THUMP domain-containing protein  100 
 
 		 184 aa  370  1e-102  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1784  THUMP domain-containing protein  87.93 
 
 		 174 aa  318  3.9999999999999996e-86  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.386874 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1164  THUMP domain-containing protein  84.39 
 
 		 175 aa  312  1.9999999999999998e-84  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1311  THUMP domain-containing protein  83.82 
 
 		 177 aa  309  1e-83  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.011341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1953  THUMP domain-containing protein  49.11 
 
 		 178 aa  169  3e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0214  THUMP domain-containing protein  32.54 
 
 		 190 aa  94.7  6e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1428  THUMP domain-containing protein  33.33 
 
 		 173 aa  77.8  0.00000000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1812  THUMP domain-containing protein  34.29 
 
 		 360 aa  52  0.000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1622  THUMP domain-containing protein  34.31 
 
 		 364 aa  47.4  0.0001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.92065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1655  THUMP domain-containing protein  31.37 
 
 		 359 aa  47  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.57853  normal  0.517535 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1613  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  33.33 
 
 		 392 aa  44.7  0.0008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.166004  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0539  THUMP domain-containing protein  30.89 
 
 		 362 aa  44.3  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0117648 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_18762  predicted protein  26.8 
 
 		 183 aa  41.6  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.249043  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>