14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1634 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_1634  putative acyl carrier protein  100 
 
 		 78 aa  148  3e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0265419  normal  0.0223773 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2339  putative acyl carrier protein  47.44 
 
 		 79 aa  83.6  8e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1534  putative acyl carrier protein  40.54 
 
 		 81 aa  62.4  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3943  putative acyl carrier protein  40.91 
 
 		 78 aa  62  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.616422 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0184  putative acyl carrier protein  40.54 
 
 		 81 aa  62.4  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.386199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0414  putative acyl carrier protein  36.62 
 
 		 80 aa  60.5  0.000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.230506  normal  0.0244859 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0883  putative acyl carrier protein  35.06 
 
 		 85 aa  55.5  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.756646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6430  putative acyl carrier protein (ACP)  36.36 
 
 		 78 aa  55.1  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0172498  normal  0.20701 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0283  acyl carrier protein, ACP  32.43 
 
 		 78 aa  45.4  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2227  phosphopantetheine-binding  37.93 
 
 		 71 aa  42  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1316  hypothetical protein  42.25 
 
 		 75 aa  41.6  0.003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.992369  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1489  acyl carrier protein, putative  39.13 
 
 		 73 aa  41.6  0.004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2031  citrate (Si)-synthase  29.85 
 
 		 473 aa  41.2  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.602388  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1302  acyl carrier protein, putative  42 
 
 		 74 aa  40.8  0.006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>