16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0895 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_0895  hypothetical protein  100 
 
 
38 aa  77.8  0.00000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0364046  normal  0.679444 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2010  hypothetical protein  57.89 
 
 
40 aa  52.4  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03090  hypothetical protein  59.46 
 
 
43 aa  52  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002882  hypothetical protein  59.46 
 
 
43 aa  52  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.454619  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2257  hypothetical protein  57.89 
 
 
40 aa  51.2  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000074834  normal  0.461351 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2329  hypothetical protein  57.89 
 
 
40 aa  51.2  0.000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000111896  normal  0.0101527 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1505  hypothetical protein  58.33 
 
 
39 aa  50.8  0.000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0108497  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2577  hypothetical protein  55.26 
 
 
40 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000600425  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2618  hypothetical protein  55.26 
 
 
40 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000018451  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2693  hypothetical protein  55.26 
 
 
40 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000672576  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1766  hypothetical protein  55.26 
 
 
40 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000000878224  hitchhiker  0.0042759 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2410  hypothetical protein  55.56 
 
 
39 aa  47.4  0.00007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000806224  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2384  hypothetical protein  57.14 
 
 
39 aa  46.6  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000123801  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0569  hypothetical protein  55.56 
 
 
43 aa  46.6  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000256902  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2238  hypothetical protein  55.56 
 
 
40 aa  45.1  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000125392  hitchhiker  0.000659162 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1790  hypothetical protein  52.78 
 
 
39 aa  42.7  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.366851  hitchhiker  0.00000715964 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>