17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1690 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1690  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 338 aa  695    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.591027 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1272  NAD-dependent epimerase/dehydratase  60.65 
 
 		 338 aa  453  1.0000000000000001e-126  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.522042 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2360  hypothetical protein  49.7 
 
 		 338 aa  365  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0972  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.11 
 
 		 347 aa  354  1e-96  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00933652  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3350  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.52 
 
 		 338 aa  349  5e-95  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.190401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0392  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.1 
 
 		 338 aa  343  2e-93  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2921  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.71 
 
 		 343 aa  301  9e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2455  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.21 
 
 		 308 aa  76.3  0.0000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3741  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.45 
 
 		 307 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3802  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.45 
 
 		 307 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0120598 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3729  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.45 
 
 		 307 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0832257  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1406  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.35 
 
 		 301 aa  68.2  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5681  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.4 
 
 		 303 aa  46.2  0.0009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.971447 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1998  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  28.48 
 
 		 302 aa  46.2  0.0009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00000898814  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1679  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.67 
 
 		 291 aa  43.5  0.006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1551  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.38 
 
 		 270 aa  42.7  0.008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1075  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.48 
 
 		 327 aa  42.7  0.01  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>