16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1453 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_1453  hypothetical protein  100 
 
 
201 aa  399  9.999999999999999e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0126  hypothetical protein  35.29 
 
 
186 aa  88.2  8e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.472778  n/a   
 
 
-
 
NC_013734  Slin_7021  hypothetical protein  32.75 
 
 
210 aa  68.2  0.00000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0811  hypothetical protein  31.63 
 
 
192 aa  65.1  0.0000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2235  hypothetical protein  30.72 
 
 
199 aa  61.6  0.000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.711886  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1517  hypothetical protein  32.75 
 
 
194 aa  57.4  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3442  hypothetical protein  26.42 
 
 
212 aa  54.7  0.0000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2505  hypothetical protein  29.46 
 
 
255 aa  53.9  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0233  hypothetical protein  25.88 
 
 
203 aa  53.1  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0742289 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4895  hypothetical protein  27.83 
 
 
233 aa  52  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.317386 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1518  hypothetical protein  30.41 
 
 
193 aa  50.4  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0812  hypothetical protein  34.26 
 
 
196 aa  46.6  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0787  hypothetical protein  23.24 
 
 
205 aa  46.6  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.696577  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1613  hypothetical protein  26.59 
 
 
199 aa  44.7  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0417  hypothetical protein  26.16 
 
 
176 aa  43.1  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4896  hypothetical protein  23.26 
 
 
224 aa  41.2  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.211147 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>