14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0601 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_0601  protein of unknown function DUF1634  100 
 
 
131 aa  258  2e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3309  protein of unknown function DUF1634  42.98 
 
 
132 aa  104  5e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.339425  hitchhiker  0.000416312 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3318  hypothetical protein  42.31 
 
 
135 aa  87.4  6e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3911  hypothetical protein  43.7 
 
 
124 aa  86.7  9e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000126391  normal  0.0429532 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3138  protein of unknown function DUF1634  38.98 
 
 
119 aa  67.8  0.00000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3786  hypothetical protein  33.87 
 
 
184 aa  67  0.00000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.173213  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1844  hypothetical protein  30.4 
 
 
124 aa  61.6  0.000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3868  protein of unknown function DUF1634  32 
 
 
121 aa  58.5  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0290618  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2524  hypothetical protein  37.61 
 
 
125 aa  56.6  0.0000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0192345  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0944  hypothetical protein  32.43 
 
 
130 aa  56.6  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1650  protein of unknown function DUF1634  40.91 
 
 
118 aa  56.2  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.12179  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4143  hypothetical protein  45.83 
 
 
101 aa  41.2  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.250184  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1183  hypothetical protein  30.99 
 
 
119 aa  41.2  0.005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.529449 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0548  hypothetical protein  27.94 
 
 
127 aa  40.4  0.008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.835755  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>