45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3933 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3933  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
179 aa  369  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4454  GNAT family acetyltransferase  32.9 
 
 
163 aa  79.7  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.156806 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2044  GCN5-related N-acetyltransferase  34.58 
 
 
190 aa  50.4  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.800468  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3561  GCN5-related N-acetyltransferase  30.46 
 
 
174 aa  50.1  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3185  GCN5-related N-acetyltransferase  29.6 
 
 
159 aa  50.1  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.082232  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4220  GCN5-related N-acetyltransferase  30.83 
 
 
151 aa  48.1  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.489383 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1874  GCN5-related N-acetyltransferase  26.28 
 
 
166 aa  47  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.545017  normal  0.907413 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0798  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 
143 aa  47  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0040  acetyltransferase  25.2 
 
 
150 aa  45.8  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1942  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 
158 aa  45.8  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.35373  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2162  GCN5-related N-acetyltransferase  30.56 
 
 
176 aa  45.4  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1664  GCN5-related N-acetyltransferase  29.2 
 
 
144 aa  45.4  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0582  GCN5-related N-acetyltransferase  27.07 
 
 
165 aa  45.4  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0137231 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0363  GCN5-related N-acetyltransferase  24.2 
 
 
175 aa  44.7  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.791622  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2162  GCN5-related N-acetyltransferase  28.22 
 
 
160 aa  44.7  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.862709  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2210  GCN5-related N-acetyltransferase  27.13 
 
 
166 aa  44.3  0.0009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0962  GCN5-related N-acetyltransferase  32.5 
 
 
172 aa  44.3  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2086  GCN5-related N-acetyltransferase  48.08 
 
 
174 aa  43.9  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.161188  normal  0.115972 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0798  GCN5-related N-acetyltransferase  42.65 
 
 
174 aa  43.9  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.631657  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2324  acetyltransferase  30.1 
 
 
146 aa  42.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.428752  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2447  acetyltransferase  30.1 
 
 
151 aa  42.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.657539  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7262  acetyltransferase  29.37 
 
 
157 aa  42.4  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2285  acetyltransferase  30.1 
 
 
146 aa  42.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0739487  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1429  acetyltransferase  30.1 
 
 
146 aa  42.7  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.993913  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3109  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 
149 aa  42.7  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0976115  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1920  acetyltransferase  30.1 
 
 
146 aa  42.7  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3384  acetyltransferase  30.1 
 
 
146 aa  42.7  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.690506  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1193  acetyltransferase  30.1 
 
 
146 aa  42.7  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0199  GCN5-related N-acetyltransferase  27.81 
 
 
176 aa  42.4  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.2414  normal  0.228085 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2410  acetyltransferase, GNAT family  24.82 
 
 
165 aa  42.4  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1282  acetyltransferase, GNAT family  26.12 
 
 
140 aa  42  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0790  GCN5-related N-acetyltransferase  28.06 
 
 
249 aa  42  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1243  GCN5-related N-acetyltransferase  33.78 
 
 
153 aa  42  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2368  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  44.26 
 
 
153 aa  42  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2975  acetyltransferase  25.35 
 
 
164 aa  41.6  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3917  GCN5-related N-acetyltransferase  39.06 
 
 
138 aa  41.6  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0544  GCN5-related N-acetyltransferase  31.31 
 
 
146 aa  41.6  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4357  GCN5-related N-acetyltransferase  33.01 
 
 
143 aa  41.2  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.744506  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3698  GCN5-related N-acetyltransferase  29.31 
 
 
160 aa  41.2  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4885  acetyltransferase  30.53 
 
 
141 aa  41.6  0.007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0578  GCN5-related N-acetyltransferase  23.57 
 
 
157 aa  41.6  0.007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0651  acetyltransferase  28.57 
 
 
149 aa  41.2  0.008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2938  GCN5-related N-acetyltransferase  35.94 
 
 
177 aa  40.8  0.009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4351  GCN5-related N-acetyltransferase  38.1 
 
 
145 aa  41.2  0.009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.620863 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3174  GCN5-related N-acetyltransferase  30.77 
 
 
169 aa  40.8  0.01  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.358356  normal  0.62215 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>