11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3417 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3417  hypothetical protein  100 
 
 		 140 aa  274  3e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.138798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33930  hypothetical protein  83.97 
 
 		 131 aa  206  1e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0392709  normal  0.15208 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2886  hypothetical protein  80.74 
 
 		 147 aa  205  1e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0803813  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50890  hypothetical protein  77.06 
 
 		 110 aa  147  5e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.455755  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26680  hypothetical protein  53.85 
 
 		 130 aa  135  2e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.286452 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1724  hypothetical protein  63.2 
 
 		 128 aa  131  3.9999999999999996e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.553906  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3041  hypothetical protein  50 
 
 		 128 aa  130  6e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.154863  normal  0.0395279 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5987  hypothetical protein  63.93 
 
 		 128 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.41743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1742  hypothetical protein  50.39 
 
 		 131 aa  107  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1060  hypothetical protein  51.18 
 
 		 129 aa  102  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1828  hypothetical protein  52.8 
 
 		 130 aa  96.7  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0824179  normal  0.0353192 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>