32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2353 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2353  hypothetical protein  100 
 
 		 192 aa  391  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.76932  normal  0.195276 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5553  hypothetical protein  46.88 
 
 		 194 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1727  hypothetical protein  48.42 
 
 		 193 aa  176  2e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0297  hypothetical protein  43.52 
 
 		 196 aa  160  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1742  hypothetical protein  43.52 
 
 		 196 aa  160  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0389  hypothetical protein  43.52 
 
 		 196 aa  159  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1158  hypothetical protein  43.01 
 
 		 196 aa  158  5e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2135  hypothetical protein  43.01 
 
 		 196 aa  158  5e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0871  hypothetical protein  43.01 
 
 		 196 aa  158  5e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1863  hypothetical protein  43.01 
 
 		 196 aa  158  5e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.743344  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2182  hypothetical protein  44.04 
 
 		 196 aa  137  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.899892  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2183  hypothetical protein  38.94 
 
 		 212 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0388  hypothetical protein  37.98 
 
 		 212 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1864  hypothetical protein  37.98 
 
 		 212 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.18918  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0296  hypothetical protein  37.98 
 
 		 212 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1741  hypothetical protein  37.98 
 
 		 212 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1159  hypothetical protein  37.98 
 
 		 212 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0872  hypothetical protein  37.98 
 
 		 212 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2136  hypothetical protein  37.5 
 
 		 212 aa  128  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1726  hypothetical protein  38.12 
 
 		 208 aa  127  8.000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5554  hypothetical protein  37.76 
 
 		 205 aa  120  8e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2354  hypothetical protein  33.66 
 
 		 208 aa  107  8.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.550165  normal  0.197243 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2846  hypothetical protein  33.85 
 
 		 164 aa  59.3  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.246134  hitchhiker  0.00000218864 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1865  hypothetical protein  50.88 
 
 		 106 aa  47.8  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.240784  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1160  hypothetical protein  50.88 
 
 		 63 aa  45.8  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0387  hypothetical protein  50.88 
 
 		 63 aa  45.8  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0873  hypothetical protein  50.88 
 
 		 63 aa  45.8  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0295  hypothetical protein  50.88 
 
 		 63 aa  45.8  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2137  hypothetical protein  50.88 
 
 		 63 aa  45.8  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2184  hypothetical protein  47.37 
 
 		 131 aa  45.8  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.998442  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000468  hypothetical protein  26.76 
 
 		 157 aa  44.7  0.0009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0103318  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2355  hypothetical protein  38.18 
 
 		 113 aa  42  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.596272  normal  0.186068 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>