126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2054 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2054  arginine succinyltransferase  100 
 
 		 338 aa  686    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52700  arginine/ornithine succinyltransferase AI subunit  59.24 
 
 		 338 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.6133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4619  arginine/ornithine succinyltransferase AI subunit  59.24 
 
 		 338 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.30321  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3985  arginine/ornithine succinyltransferase, alpha subunit  58.41 
 
 		 339 aa  403  1e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3769  arginine/ornithine succinyltransferase, alpha subunit  58.11 
 
 		 339 aa  402  1e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0115 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4480  arginine N-succinyltransferase, alpha subunit  57.35 
 
 		 339 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.98058  normal  0.247147 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4284  arginine succinyltransferase  59.29 
 
 		 339 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.584908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1435  arginine N-succinyltransferase  57.52 
 
 		 339 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.888596  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1833  arginine N-succinyltransferase, alpha subunit  56.85 
 
 		 343 aa  397  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.882626  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3564  arginine N-succinyltransferase  56.56 
 
 		 343 aa  395  1e-109  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0659293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2910  arginine succinyltransferase  58.58 
 
 		 338 aa  394  1e-108  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.500754 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34490  arginine N-succinyltransferase  57.02 
 
 		 338 aa  391  1e-107  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3668  arginine N-succinyltransferase  42.11 
 
 		 337 aa  266  2.9999999999999995e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0458765  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0635  arginine N-succinyltransferase  38.46 
 
 		 338 aa  250  2e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1559  arginine/ornithine succinyltransferase, alpha subunit  40.41 
 
 		 352 aa  248  1e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.758428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1062  arginine N-succinyltransferase  39.71 
 
 		 353 aa  245  8e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3753  arginine N-succinyltransferase  37.76 
 
 		 339 aa  245  9e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0646  arginine N-succinyltransferase  37.76 
 
 		 339 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1786  arginine/ornithine succinyltransferase, alpha subunit  40.59 
 
 		 350 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0572  arginine N-succinyltransferase  37.76 
 
 		 339 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3696  arginine N-succinyltransferase  37.76 
 
 		 339 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3879  arginine N-succinyltransferase  37.76 
 
 		 339 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4292  arginine succinyltransferase  40.35 
 
 		 350 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2123  arginine/ornithine succinyltransferase, alpha subunit  40.12 
 
 		 350 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.648146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2843  arginine succinyltransferase  39.12 
 
 		 344 aa  242  5e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.836294  hitchhiker  0.00555507 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2922  arginine succinyltransferase  39.88 
 
 		 352 aa  242  6e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.792239 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0702  arginine N-succinyltransferase  39.77 
 
 		 355 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1181  arginine N-succinyltransferase  39.77 
 
 		 355 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1776  arginine N-succinyltransferase, alpha chain  40.71 
 
 		 352 aa  241  1e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.905636  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1062  arginine/ornithine succinyltransferase, alpha subunit  39.18 
 
 		 353 aa  241  1e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0200119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1158  arginine/ornithine succinyltransferase, alpha subunit  39.53 
 
 		 355 aa  240  2e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.266781  normal  0.0623877 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2807  arginine succinyltransferase  40.18 
 
 		 354 aa  237  2e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2846  arginine N-succinyltransferase beta subunit  40.41 
 
 		 352 aa  236  4e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2726  arginine N-succinyltransferase, alpha subunit  40.41 
 
 		 352 aa  236  4e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2784  arginine N-succinyltransferase, alpha subunit  40.41 
 
 		 352 aa  236  4e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0810  arginine N-succinyltransferase  37.46 
 
 		 339 aa  236  4e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00028495 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3192  arginine N-succinyltransferase  36.58 
 
 		 339 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0337373  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2228  arginine succinyltransferase  37.97 
 
 		 350 aa  236  5.0000000000000005e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1055  arginine N-succinyltransferase  37.64 
 
 		 347 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2519  arginine succinyltransferase  37.97 
 
 		 350 aa  234  1.0000000000000001e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0592  arginine N-succinyltransferase, alpha chain  39.64 
 
 		 346 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2424  arginine N-succinyltransferase, alpha chain  39.64 
 
 		 346 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.1511  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2867  arginine N-succinyltransferase, alpha chain  39.64 
 
 		 346 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1735  arginine N-succinyltransferase, alpha chain  39.64 
 
 		 346 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.680184  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3669  arginine N-succinyltransferase  36.89 
 
 		 350 aa  234  2.0000000000000002e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.386578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2120  arginine succinyltransferase  37.79 
 
 		 349 aa  233  3e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52690  arginine/ornithine succinyltransferase AII subunit  38.58 
 
 		 340 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.433336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1969  arginine succinyltransferase  38.3 
 
 		 344 aa  232  8.000000000000001e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3563  arginine N-succinyltransferase  37.69 
 
 		 341 aa  231  9e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.179201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0656  arginine N-succinyltransferase  37.54 
 
 		 339 aa  231  9e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.868394  hitchhiker  0.0000048698 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3010  arginine N-succinyltransferase  38.42 
 
 		 339 aa  231  1e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0650  arginine N-succinyltransferase  36.61 
 
 		 344 aa  230  2e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.202921  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2909  arginine succinyltransferase  38.28 
 
 		 338 aa  230  2e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.633986 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01716  arginine succinyltransferase  38.01 
 
 		 344 aa  230  3e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1895  arginine N-succinyltransferase  38.01 
 
 		 344 aa  230  3e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.564615  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2465  arginine succinyltransferase  38.01 
 
 		 344 aa  230  3e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01704  hypothetical protein  38.01 
 
 		 344 aa  230  3e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1830  arginine succinyltransferase  38.01 
 
 		 344 aa  230  3e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1885  arginine succinyltransferase  38.01 
 
 		 344 aa  230  3e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0106586 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1444  arginine succinyltransferase  38.01 
 
 		 344 aa  230  3e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.606563 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1834  arginine N-succinyltransferase, beta subunit  36.8 
 
 		 341 aa  229  5e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.860406  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1994  arginine succinyltransferase  38.01 
 
 		 344 aa  229  5e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4618  arginine/ornithine succinyltransferase AII subunit  38.28 
 
 		 340 aa  229  5e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.311562  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1399  arginine succinyltransferase  39.18 
 
 		 344 aa  229  6e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.121302 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1869  arginine succinyltransferase  39.18 
 
 		 344 aa  229  6e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1431  arginine succinyltransferase  38.6 
 
 		 344 aa  228  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.899315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1416  arginine succinyltransferase  38.6 
 
 		 344 aa  228  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2042  arginine succinyltransferase  38.6 
 
 		 344 aa  228  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0825718  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1665  arginine N-succinyltransferase, beta chain  37.39 
 
 		 347 aa  226  3e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0164  arginine N-succinyltransferase  38.91 
 
 		 346 aa  226  3e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.468749  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1627  arginine N-succinyltransferase  37.54 
 
 		 348 aa  227  3e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.299273 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0618  arginine N-succinyltransferase  36.58 
 
 		 339 aa  226  4e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4283  arginine succinyltransferase  36.5 
 
 		 341 aa  226  4e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.795056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3418  arginine succinyltransferase  35.99 
 
 		 339 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0994163 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0579  arginine N-succinyltransferase  37.54 
 
 		 339 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.934676 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0612  arginine succinyltransferase  35.99 
 
 		 339 aa  226  6e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0611  arginine succinyltransferase  35.99 
 
 		 339 aa  226  6e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0978523 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1697  arginine succinyltransferase  37.46 
 
 		 344 aa  225  1e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1671  arginine N-succinyltransferase, beta chain  37.2 
 
 		 346 aa  224  2e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34480  arginine N-succinyltransferase  38.64 
 
 		 345 aa  224  2e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3298  arginine N-succinyltransferase  36.58 
 
 		 339 aa  223  4e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3515  arginine N-succinyltransferase  37.24 
 
 		 339 aa  223  4e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0485  arginine succinyltransferase  37.35 
 
 		 344 aa  222  8e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.468224  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3768  arginine N-succinyltransferase  37.28 
 
 		 342 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.243261  normal  0.0192708 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3984  arginine N-succinyltransferase  36.98 
 
 		 342 aa  219  5e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3317  arginine N-succinyltransferase  36.15 
 
 		 361 aa  218  1e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00498  arginine N-succinyltransferase  37.39 
 
 		 345 aa  218  1e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1436  arginine N-succinyltransferase  36.69 
 
 		 342 aa  217  2e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4479  arginine N-succinyltransferase, beta subunit  36.69 
 
 		 342 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.198516  normal  0.241866 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2734  arginine N-succinyltransferase  36.13 
 
 		 339 aa  208  8e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1063  arginine N-succinyltransferase  36.52 
 
 		 348 aa  206  4e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1063  arginine N-succinyltransferase  36.34 
 
 		 347 aa  204  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0114093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2921  arginine succinyltransferase  36.09 
 
 		 343 aa  202  7e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.651402  normal  0.342556 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0883  arginine succinyltransferase  34.02 
 
 		 345 aa  202  8e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.174815  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2806  arginine succinyltransferase  36.84 
 
 		 338 aa  202  8e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2194  putative arginine/ornithine succinyltransferase  33.63 
 
 		 339 aa  201  1.9999999999999998e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2890  arginine N-succinyltransferase  35.76 
 
 		 366 aa  200  3e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.210367  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1159  arginine N-succinyltransferase  36.84 
 
 		 343 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.26404  normal  0.0654026 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0703  arginine N-succinyltransferase  36.84 
 
 		 343 aa  199  5e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.891122  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1182  arginine N-succinyltransferase  36.84 
 
 		 343 aa  199  5e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.187182  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>