23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_1225 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_1225  hypothetical protein  100 
 
 
278 aa  577  1e-164  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3050  hypothetical protein  86.33 
 
 
276 aa  487  1e-137  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3652  hypothetical protein  46.99 
 
 
290 aa  230  2e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1084  hypothetical protein  57.75 
 
 
261 aa  223  3e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2769  hypothetical protein  45.61 
 
 
252 aa  218  1e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1151  hypothetical protein  50 
 
 
350 aa  211  9e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3628  hypothetical protein  48.46 
 
 
331 aa  210  2e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1258  hypothetical protein  48.46 
 
 
355 aa  210  2e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3040  hypothetical protein  47.21 
 
 
254 aa  183  2.0000000000000003e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.177948 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2708  hypothetical protein  46.76 
 
 
239 aa  170  2e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2708  hypothetical protein  48.99 
 
 
237 aa  170  2e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2920  hypothetical protein  46.45 
 
 
239 aa  169  3e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.999465  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02411  hypothetical protein  46.45 
 
 
237 aa  169  3e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02447  hypothetical protein  46.45 
 
 
237 aa  169  3e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1122  hypothetical protein  46.45 
 
 
237 aa  169  3e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1113  putative lipoprotein  46.45 
 
 
237 aa  169  3e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2840  hypothetical protein  46.3 
 
 
239 aa  169  4e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3789  hypothetical protein  49.47 
 
 
211 aa  168  8e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2722  hypothetical protein  47.12 
 
 
228 aa  155  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2939  hypothetical protein  47.12 
 
 
228 aa  155  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2764  hypothetical protein  47.12 
 
 
228 aa  155  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2805  hypothetical protein  47.12 
 
 
228 aa  155  8e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2826  hypothetical protein  47.12 
 
 
228 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.374419  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>