14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_2349 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_2349  hypothetical protein  100 
 
 
87 aa  175  1e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000863109  normal  0.0220704 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2046  hypothetical protein  93.1 
 
 
87 aa  165  2e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000343209  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2294  hypothetical protein  39.77 
 
 
102 aa  63.5  0.0000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00328626  hitchhiker  0.00199724 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4381  hypothetical protein  33.73 
 
 
84 aa  54.3  0.0000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.735891 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3462  hypothetical protein  37.35 
 
 
111 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.438272 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4810  hypothetical protein  32.53 
 
 
87 aa  52.4  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0802082  hitchhiker  0.00240732 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0176  hypothetical protein  32.94 
 
 
84 aa  48.9  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000154449  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0234  hypothetical protein  31.76 
 
 
84 aa  48.5  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7138  hypothetical protein  28.92 
 
 
88 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1870  hypothetical protein  40 
 
 
85 aa  47  0.00008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000823152  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0631  hypothetical protein  32.53 
 
 
82 aa  47  0.00009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2786  hypothetical protein  34.94 
 
 
91 aa  46.6  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.758487  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6355  hypothetical protein  24.1 
 
 
87 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.15552 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2566  hypothetical protein  31.03 
 
 
85 aa  45.1  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000021382  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>