21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1705 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1705  hypothetical protein  100 
 
 		 91 aa  185  1e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2131  hypothetical protein  73.63 
 
 		 91 aa  149  2e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4336  hypothetical protein  66.67 
 
 		 90 aa  137  3.9999999999999997e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.022904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5720  hypothetical protein  65.56 
 
 		 90 aa  134  4e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.470242  normal  0.791628 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0894  hypothetical protein  63.33 
 
 		 90 aa  134  5e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00183124  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3576  hypothetical protein  62.22 
 
 		 90 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.221494  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2091  hypothetical protein  57.78 
 
 		 90 aa  130  7.999999999999999e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0395312  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1286  hypothetical protein  62.22 
 
 		 90 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.3216500000000004e-18 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4610  hypothetical protein  55.56 
 
 		 90 aa  115  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.553384  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2189  hypothetical protein  52.22 
 
 		 90 aa  113  8.999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1968  hypothetical protein  56.67 
 
 		 92 aa  112  1.0000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2377  hypothetical protein  44.44 
 
 		 90 aa  96.7  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0704345  hitchhiker  0.00399163 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5917  hypothetical protein  49.45 
 
 		 93 aa  95.5  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.567263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5212  hypothetical protein  45.56 
 
 		 95 aa  95.5  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1930  hypothetical protein  42.7 
 
 		 93 aa  90.1  9e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6474  hypothetical protein  36.36 
 
 		 86 aa  57  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.151582  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3546  hypothetical protein  32.95 
 
 		 91 aa  50.4  0.000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0703945  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2065  hypothetical protein  35.71 
 
 		 103 aa  49.3  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7096  hypothetical protein  25 
 
 		 118 aa  44.3  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.21263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0406  hypothetical protein  21.59 
 
 		 88 aa  43.5  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3283  hypothetical protein  29.82 
 
 		 106 aa  42  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.114531  normal  0.185458 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>