46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1146 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_1146  flagellar assembly protein FliW  100 
 
 
140 aa  286  7e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0605  flagellar assembly protein FliW  48.91 
 
 
154 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2233  flagellar assembly protein FliW  36.84 
 
 
151 aa  104  3e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000631817 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0749  hypothetical protein  35.51 
 
 
158 aa  95.1  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.746617 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3040  flagellar assembly protein FliW  39.1 
 
 
159 aa  94.7  4e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2240  flagellar assembly protein FliW  38.64 
 
 
159 aa  92.4  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.268848  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0098  flagellar assembly protein FliW  32.84 
 
 
148 aa  85.1  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1670  flagellar assembly protein FliW  34.75 
 
 
152 aa  84  7e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4096  flagellar assembly protein FliW  35.04 
 
 
163 aa  83.6  8e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0454  flagellar assembly protein FliW  34.81 
 
 
165 aa  83.6  9e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0081  hypothetical protein  32.84 
 
 
162 aa  82  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.171449 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0441  flagellar assembly protein FliW  34.59 
 
 
153 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0391  hypothetical protein  29.5 
 
 
157 aa  81.6  0.000000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0247  flagellar assembly protein FliW  27.94 
 
 
142 aa  79  0.00000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0670  protein of unknown function DUF180  33.07 
 
 
159 aa  77  0.00000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0326033 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0866  flagellar assembly protein FliW  30.6 
 
 
149 aa  77  0.00000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0843  flagellar assembly protein FliW  30.6 
 
 
149 aa  76.6  0.0000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2354  flagellar assembly protein FliW  31.82 
 
 
147 aa  75.1  0.0000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0020  protein of unknown function DUF180  35.04 
 
 
153 aa  74.7  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4192  protein of unknown function DUF180  30.08 
 
 
152 aa  73.9  0.0000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17100  hypothetical protein  28.79 
 
 
156 aa  73.2  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1512  flagellar assembly protein FliW  29.85 
 
 
146 aa  71.2  0.000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0195  hypothetical protein  27.87 
 
 
156 aa  70.5  0.000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3149  flagellar assembly protein FliW  28.26 
 
 
168 aa  70.5  0.000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.212103  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2400  flagellar assembly protein FliW  33.33 
 
 
156 aa  70.5  0.000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3225  flagellar assembly protein FliW  34.62 
 
 
144 aa  69.3  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2527  flagellar assembly protein FliW  28.06 
 
 
183 aa  68.6  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1619  protein of unknown function DUF180  33.59 
 
 
135 aa  68.9  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.500086 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3027  flagellar assembly protein FliW  31.62 
 
 
144 aa  68.9  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1998  flagellar assembly protein FliW  33.6 
 
 
166 aa  66.2  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0308  hypothetical protein  26.67 
 
 
156 aa  64.3  0.0000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2419  flagellar assembly protein FliW  29.27 
 
 
173 aa  63.5  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.423984 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0613  protein of unknown function DUF180  27.41 
 
 
152 aa  62.4  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0991  protein of unknown function DUF180  31.93 
 
 
134 aa  60.1  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.277232  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2359  protein of unknown function DUF180  35.25 
 
 
170 aa  58.9  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0667  protein of unknown function DUF180  26.72 
 
 
159 aa  58.2  0.00000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2416  hypothetical protein  30.28 
 
 
136 aa  54.7  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2743  flagellar assembly protein FliW  29.92 
 
 
161 aa  54.7  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31350  hypothetical protein  29.51 
 
 
128 aa  52.8  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0333034 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0183  flagellar assembly protein FliW  25.95 
 
 
130 aa  52.8  0.000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0771  hypothetical protein  33.62 
 
 
135 aa  52.8  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0820  flagellar assembly protein FliW  28.12 
 
 
145 aa  50.1  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.900553  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0830  hypothetical protein  32.76 
 
 
145 aa  47.8  0.00005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.258231  normal  0.70699 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1620  protein of unknown function DUF180  30.08 
 
 
136 aa  47  0.00008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.500086 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0959  flagellar assembly protein FliW  28.18 
 
 
131 aa  42  0.003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.67703  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2043  protein of unknown function DUF180  28 
 
 
123 aa  40.8  0.007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.937686 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>