12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1092 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_1374  hypothetical protein  34.81 
 
 		 1459 aa  763    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.153977  normal  0.0344633 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1092  hypothetical protein  100 
 
 		 1431 aa  2927    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0637  hypothetical protein  33.36 
 
 		 1448 aa  722    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4333  hypothetical protein  34.62 
 
 		 1444 aa  791    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4013  hypothetical protein  34.07 
 
 		 1485 aa  674    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.29375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3497  hypothetical protein  28.34 
 
 		 1425 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.197991 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2395  hypothetical protein  31.9 
 
 		 1432 aa  255  4.0000000000000004e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.86656  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1283  hypothetical protein  29.94 
 
 		 1421 aa  239  4e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000525148 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0505  transposase  22.97 
 
 		 639 aa  74.3  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.804069  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0672  hypothetical protein  20.49 
 
 		 1124 aa  49.7  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0145  normal  0.532736 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5230  hypothetical protein  27.08 
 
 		 1335 aa  47.8  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.211402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1811  hypothetical protein  22.43 
 
 		 1339 aa  45.4  0.009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.455816  normal  0.488445 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>