13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0843 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_0843  hypothetical protein  100 
 
 
278 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000182061  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1250  hypothetical protein  51.64 
 
 
280 aa  294  1e-78  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00375615  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1187  hypothetical protein  30.03 
 
 
323 aa  149  5e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1744  hypothetical protein  31.79 
 
 
273 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0480731 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1323  hypothetical protein  31.91 
 
 
277 aa  124  2e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.598167  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1270  hypothetical protein  32.82 
 
 
277 aa  122  6e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.141795  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0435  hypothetical protein  31.28 
 
 
277 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1122  hypothetical protein  34.39 
 
 
280 aa  119  6e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.202357  normal  0.329885 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0306  hypothetical protein  28.79 
 
 
212 aa  90.5  2e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.54292  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0441  hypothetical protein  27.92 
 
 
221 aa  81.6  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0790012  normal  0.469001 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1745  hypothetical protein  26.92 
 
 
175 aa  55.5  0.0000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.535818  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0236  hypothetical protein  30 
 
 
160 aa  51.2  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0144969  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3183  hypothetical protein  24.59 
 
 
177 aa  42.4  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>