11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1546 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_1546  hypothetical protein  100 
 
 
301 aa  601  1.0000000000000001e-171  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0021  hypothetical protein  73.93 
 
 
305 aa  441  1e-123  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1056  hypothetical protein  76.39 
 
 
306 aa  439  9.999999999999999e-123  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.730009 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0934  hypothetical protein  76.04 
 
 
305 aa  433  1e-120  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00193812 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0751  hypothetical protein  48.5 
 
 
310 aa  261  1e-68  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0376  hypothetical protein  39.16 
 
 
294 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.833365  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0428  hypothetical protein  43 
 
 
323 aa  212  7e-54  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0584  hypothetical protein  39.47 
 
 
309 aa  199  3.9999999999999996e-50  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.43357 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0982  beta-lactamase domain protein  36.54 
 
 
308 aa  187  1e-46  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0208457  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1358  hypothetical protein  33.11 
 
 
273 aa  170  2e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000906446  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2763  hypothetical protein  30.79 
 
 
302 aa  105  9e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0324358 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>