12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1164 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1164  THUMP domain-containing protein  100 
 
 		 175 aa  353  5e-97  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0341  THUMP domain-containing protein  84.39 
 
 		 184 aa  312  9.999999999999999e-85  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1311  THUMP domain-containing protein  82.29 
 
 		 177 aa  308  2e-83  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.011341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1784  THUMP domain-containing protein  84.97 
 
 		 174 aa  308  2.9999999999999997e-83  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.386874 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1953  THUMP domain-containing protein  51.48 
 
 		 178 aa  173  9.999999999999999e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0214  THUMP domain-containing protein  34.91 
 
 		 190 aa  96.3  2e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1428  THUMP domain-containing protein  32.94 
 
 		 173 aa  73.2  0.000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1812  THUMP domain-containing protein  39.02 
 
 		 360 aa  49.7  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1622  THUMP domain-containing protein  36.47 
 
 		 364 aa  45.8  0.0003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.92065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0539  THUMP domain-containing protein  36.36 
 
 		 362 aa  44.3  0.0008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0117648 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_18762  predicted protein  28.43 
 
 		 183 aa  42  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.249043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1613  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  30.38 
 
 		 392 aa  40.8  0.009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.166004  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>