43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1015 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_1015  phosphate uptake regulator, PhoU  100 
 
 
297 aa  595  1e-169  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.313422 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1287  phosphate uptake regulator, PhoU  72.05 
 
 
297 aa  457  1e-127  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1831  phosphate uptake regulator, PhoU  71.72 
 
 
297 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000000208314 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2081  phosphate uptake regulator, PhoU  71.38 
 
 
297 aa  449  1e-125  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0893566 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1109  SpoVT/AbrB domain-containing protein  33.44 
 
 
331 aa  170  3e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.235676  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1545  phosphate uptake regulator, PhoU  24.63 
 
 
332 aa  73.9  0.000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2476  phosphate uptake regulator, PhoU  22.59 
 
 
331 aa  73.6  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1682  phosphate uptake regulator, PhoU  28.89 
 
 
336 aa  72.8  0.000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0595  phosphate uptake regulator, PhoU  24.62 
 
 
335 aa  70.5  0.00000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3440  phosphate uptake regulator, PhoU  23.7 
 
 
331 aa  68.9  0.00000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1600  phosphate uptake regulator, PhoU  28.86 
 
 
299 aa  66.6  0.0000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0620  phosphate uptake regulator, PhoU  22.26 
 
 
336 aa  65.9  0.0000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0495  phosphate uptake regulator, PhoU  20.24 
 
 
331 aa  65.1  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0693  phosphate uptake regulator, PhoU  27.35 
 
 
343 aa  65.5  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.571595  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1393  phosphate uptake regulator, PhoU  24.54 
 
 
335 aa  63.2  0.000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1968  phosphate uptake regulator, PhoU  24.51 
 
 
336 aa  63.2  0.000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0479  phosphate uptake regulator, PhoU  23.5 
 
 
337 aa  60.8  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2356  phosphate uptake regulator, PhoU  24.21 
 
 
334 aa  59.7  0.00000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1604  phosphate uptake regulator, PhoU  22.47 
 
 
348 aa  57.8  0.0000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1386  phosphate uptake regulator, PhoU  25.27 
 
 
343 aa  55.8  0.0000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2335  phosphate uptake regulator, PhoU  25.11 
 
 
343 aa  55.5  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1119  hypothetical protein  24.27 
 
 
333 aa  55.5  0.000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.588146  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1717  phosphate uptake regulator, PhoU  20.14 
 
 
326 aa  54.7  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0358933 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2336  phosphate uptake regulator, PhoU  24.55 
 
 
344 aa  53.5  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.119502  normal  0.953358 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1069  phosphate uptake regulator, PhoU  25.68 
 
 
340 aa  53.1  0.000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0944  phosphate uptake regulator, PhoU  22.64 
 
 
337 aa  52.8  0.000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1794  phosphate uptake regulator, PhoU  21.19 
 
 
332 aa  53.1  0.000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0479748 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1065  phosphate uptake regulator, PhoU  22.6 
 
 
316 aa  53.1  0.000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0914  phosphate uptake regulator, PhoU  19.78 
 
 
334 aa  52.4  0.000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0312  phosphate uptake regulator, PhoU  24.38 
 
 
344 aa  51.6  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1926  phosphate uptake regulator, PhoU  23.71 
 
 
330 aa  51.2  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.820933  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0860  phosphate uptake regulator, PhoU  24.1 
 
 
339 aa  51.2  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.198015 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0447  phosphate uptake regulator, PhoU  24.36 
 
 
349 aa  50.4  0.00003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000672536  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1622  SpoVT/AbrB domain-containing protein  22.58 
 
 
349 aa  50.1  0.00004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00903094  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0430  SpoVT/AbrB domain protein  24.74 
 
 
315 aa  48.5  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3128  hypothetical protein  22.04 
 
 
304 aa  48.9  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2363  phosphate uptake regulator, PhoU  19.46 
 
 
344 aa  48.9  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.486275  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1765  hypothetical protein  20.43 
 
 
336 aa  47.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2400  phosphate uptake regulator, PhoU  23.16 
 
 
344 aa  47.4  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.282043 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2950  putative regulatory protein  22.22 
 
 
293 aa  46.6  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11037  normal  0.0119157 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0897  phosphate uptake regulator, PhoU  22.63 
 
 
331 aa  44.3  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.247428  normal  0.168685 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1597  SpoVT/AbrB domain protein  26.14 
 
 
327 aa  42.7  0.007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.755665  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1883  hypothetical protein  25.94 
 
 
277 aa  42.4  0.008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.85602 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>