31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_4139 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_4139  hypothetical protein  100 
 
 		 376 aa  767    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.153344  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0375  hypothetical protein  36.89 
 
 		 382 aa  286  5e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03982  hypothetical protein  31.93 
 
 		 369 aa  220  3e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.47471  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5355  hypothetical protein  30.3 
 
 		 393 aa  190  4e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1412  hypothetical protein  28.69 
 
 		 358 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4190  hypothetical protein  27.89 
 
 		 395 aa  171  3e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29120  hypothetical protein  28.88 
 
 		 361 aa  168  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00446947 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3985  hypothetical protein  28.35 
 
 		 361 aa  168  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.315148  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1600  hypothetical protein  27.3 
 
 		 357 aa  166  5.9999999999999996e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.867208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1789  hypothetical protein  27.63 
 
 		 364 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.651057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3749  hypothetical protein  28.21 
 
 		 379 aa  162  6e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3903  hypothetical protein  26.48 
 
 		 356 aa  160  5e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1582  hypothetical protein  26.76 
 
 		 355 aa  158  1e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.422595  normal  0.277534 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2262  hypothetical protein  26.04 
 
 		 413 aa  154  2e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.279668  normal  0.10352 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12788  hypothetical protein  27.2 
 
 		 401 aa  151  2e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.405764  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4093  hypothetical protein  28.45 
 
 		 357 aa  142  9e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1317  hypothetical protein  28.45 
 
 		 357 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.828005  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4572  hypothetical protein  28.17 
 
 		 357 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3872  hypothetical protein  26.14 
 
 		 357 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.286953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0193  hypothetical protein  24.65 
 
 		 397 aa  115  8.999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1873  hypothetical protein  24.79 
 
 		 385 aa  89.7  8e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.146136  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1794  hypothetical protein  24.79 
 
 		 385 aa  88.6  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.400536  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0142  hypothetical protein  23.29 
 
 		 541 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0125  hypothetical protein  23.29 
 
 		 541 aa  83.6  0.000000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2083  hypothetical protein  23.34 
 
 		 385 aa  80.9  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.213207  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1745  hypothetical protein  22.09 
 
 		 384 aa  79.7  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.886322  normal  0.285515 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2039  hypothetical protein  22.97 
 
 		 1061 aa  53.5  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0319037  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2796  hypothetical protein  20.51 
 
 		 1069 aa  47.8  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3077  hypothetical protein  25 
 
 		 1041 aa  45.1  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.266808  normal  0.0188552 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0273  hypothetical protein  22.73 
 
 		 1098 aa  43.9  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1595  hypothetical protein  18.22 
 
 		 1128 aa  43.5  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.419311  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>