14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2169 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_2169  type IV pilus assembly PilZ  100 
 
 		 100 aa  203  5e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02393  membrane protein-like protein  63.64 
 
 		 66 aa  86.7  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.432482  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2244  hypothetical protein  44 
 
 		 99 aa  85.1  3e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.934041  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1881  type IV pilus assembly PilZ  38.38 
 
 		 96 aa  62.8  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1111  hypothetical protein  35.35 
 
 		 106 aa  58.9  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1928  type IV pilus assembly PilZ  34.02 
 
 		 99 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.40036 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2358  hypothetical protein  30.93 
 
 		 99 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27930  hypothetical protein  30.93 
 
 		 99 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2116  hypothetical protein  26.8 
 
 		 99 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.016829  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1911  hypothetical protein  26.8 
 
 		 99 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.309436  hitchhiker  0.00132247 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1681  type IV pilus assembly PilZ  25.77 
 
 		 99 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.936113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1618  type IV pilus assembly PilZ  27.71 
 
 		 99 aa  43.5  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.837272 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2164  type IV pilus assembly PilZ  23.71 
 
 		 99 aa  41.2  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0370021  normal  0.992287 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3578  type IV pilus assembly PilZ  23.71 
 
 		 99 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00410027  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>