20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1631 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1631  hypothetical protein  100 
 
 		 431 aa  900    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.332695  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02631  putative lipoprotein  45.83 
 
 		 427 aa  378  1e-103  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2145  pectinacetylesterase putative  29.58 
 
 		 339 aa  142  9e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0583729  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1456  putative esterase  27.32 
 
 		 349 aa  134  3e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.481499  normal  0.243415 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0548  putative lipoprotein  26.6 
 
 		 377 aa  107  3e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0335  putative lipoprotein  29.88 
 
 		 359 aa  101  3e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.484636 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2331  hypothetical protein  26.89 
 
 		 405 aa  82  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.171061  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4076  hypothetical protein  26.48 
 
 		 435 aa  82  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.167257  normal  0.0385809 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1006  hypothetical protein  30.58 
 
 		 462 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2451  putative lipoprotein  23.99 
 
 		 383 aa  80.9  0.00000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.181885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2665  hypothetical protein  27.94 
 
 		 374 aa  80.1  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.923291  normal  0.0999002 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0348  hypothetical protein  30.1 
 
 		 465 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1893  hypothetical protein  30.1 
 
 		 461 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1230  hypothetical protein  30.1 
 
 		 461 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1221  hypothetical protein  30.1 
 
 		 465 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0802  hypothetical protein  30.1 
 
 		 461 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1065  hypothetical protein  30.1 
 
 		 461 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.185724  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3005  hypothetical protein  27.93 
 
 		 458 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.23455  normal  0.291199 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1375  hypothetical protein  30.1 
 
 		 461 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.912921  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2411  hypothetical protein  26.85 
 
 		 467 aa  77.8  0.0000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.409179  normal  0.0792191 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>