13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1845 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_1845  hypothetical protein  100 
 
 
411 aa  823    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2045  hypothetical protein  58.09 
 
 
408 aa  469  1.0000000000000001e-131  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.107819  normal  0.27128 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0398  hypothetical protein  53.81 
 
 
410 aa  416  9.999999999999999e-116  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0194907  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2775  hypothetical protein  52.39 
 
 
412 aa  414  1e-114  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.717789  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1807  hypothetical protein  52.26 
 
 
411 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1573  hypothetical protein  50.87 
 
 
418 aa  387  1e-106  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00652866 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0652  hypothetical protein  46.19 
 
 
411 aa  364  2e-99  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.828544  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1682  hypothetical protein  45.82 
 
 
422 aa  361  1e-98  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.246991  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1102  hypothetical protein  27.3 
 
 
404 aa  162  9e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1818  hypothetical protein  31.67 
 
 
238 aa  97.4  4e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0814  LigA  27.94 
 
 
557 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0862  LigA  32.93 
 
 
544 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0866  LigA  32.93 
 
 
542 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>