14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1122 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_1122  hypothetical protein  100 
 
 
280 aa  570  1.0000000000000001e-162  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.202357  normal  0.329885 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0435  hypothetical protein  76.17 
 
 
277 aa  423  1e-117  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1270  hypothetical protein  66.19 
 
 
277 aa  377  1e-103  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.141795  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1323  hypothetical protein  59.71 
 
 
277 aa  361  8e-99  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.598167  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1744  hypothetical protein  56.16 
 
 
273 aa  313  1.9999999999999998e-84  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0480731 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0441  hypothetical protein  56.36 
 
 
221 aa  260  2e-68  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0790012  normal  0.469001 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0236  hypothetical protein  52.63 
 
 
160 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0144969  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1745  hypothetical protein  52.82 
 
 
175 aa  154  2e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.535818  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1250  hypothetical protein  34.75 
 
 
280 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00375615  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0843  hypothetical protein  35.43 
 
 
278 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000182061  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1187  hypothetical protein  25.85 
 
 
323 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0306  hypothetical protein  39.84 
 
 
212 aa  92  1e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.54292  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3183  hypothetical protein  38.89 
 
 
177 aa  58.5  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3703  hypothetical protein  37.5 
 
 
140 aa  51.2  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.780852 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>