14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0932 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_0932  hypothetical protein  100 
 
 		 303 aa  620  1e-177  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0973643 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1216  hypothetical protein  48.04 
 
 		 302 aa  261  6.999999999999999e-69  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.256676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0819  hypothetical protein  46.9 
 
 		 302 aa  243  3e-63  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1201  hypothetical protein  43.88 
 
 		 245 aa  154  2e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.800385  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2866  hypothetical protein  30.2 
 
 		 277 aa  102  6e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1412  hypothetical protein  29.46 
 
 		 282 aa  100  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2539  hypothetical protein  27.56 
 
 		 285 aa  95.5  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2479  hypothetical protein  28.89 
 
 		 293 aa  94  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.322617  normal  0.362973 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11403  hypothetical protein  26.48 
 
 		 296 aa  94.7  2e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.306099  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3751  hypothetical protein  24.07 
 
 		 276 aa  66.2  0.0000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  24.74 
 
 		 696 aa  43.5  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04160  putatitve transcriptional regulator  29.03 
 
 		 329 aa  42.4  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5059  SdiA-regulated domain-containing protein  34.15 
 
 		 306 aa  42.4  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.181452  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5152  SdiA-regulated domain protein  32.93 
 
 		 306 aa  42.4  0.01  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.767361 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>