11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0407 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_0407  hypothetical protein  100 
 
 
184 aa  379  1e-104  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.233585 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0442  hypothetical protein  54.19 
 
 
196 aa  161  6e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.116693  normal  0.471069 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0337  hypothetical protein  45.1 
 
 
179 aa  142  3e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1743  hypothetical protein  44.97 
 
 
187 aa  137  7e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0478046 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0470  hypothetical protein  43.87 
 
 
170 aa  121  7e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0439  hypothetical protein  40.88 
 
 
169 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0404  hypothetical protein  44.31 
 
 
168 aa  115  3e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.346241  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0471  hypothetical protein  32.26 
 
 
156 aa  56.6  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0338  hypothetical protein  24.29 
 
 
189 aa  53.1  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0405  hypothetical protein  27.96 
 
 
193 aa  49.3  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.17242  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0545  hypothetical protein  23.53 
 
 
220 aa  48.5  0.00006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.108956  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>