12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_06252 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_05704  ISXo8 transposase  98.59 
 
 
426 aa  148  2e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02889  ISXo8 transposase  97.18 
 
 
483 aa  146  1.0000000000000001e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04445  trancated ISXo8 transposase  97.18 
 
 
205 aa  144  3e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0905837  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01064  putative ISXo8 transposase  100 
 
 
71 aa  144  4.0000000000000006e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.105626  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01067  putative ISXo8 transposase  100 
 
 
71 aa  144  4.0000000000000006e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0457784  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06252  putative ISXo8 transposase  100 
 
 
71 aa  144  4.0000000000000006e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00053977  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06255  putative ISXo8 transposase  100 
 
 
71 aa  144  4.0000000000000006e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00261059  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00516  ISXo8 transposase  95.77 
 
 
483 aa  144  5e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.445658  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00316  trancated ISXo8 transposase  95.77 
 
 
351 aa  144  6e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.570506  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01495  putative ISXo8 transposase  97.18 
 
 
98 aa  140  5e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02584  trancated ISXo8 transposase  94.37 
 
 
205 aa  140  5e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02313  Transposase  97.18 
 
 
98 aa  139  9.999999999999999e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>