12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_04485 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_04485  hypothetical protein  100 
 
 
231 aa  475  1e-133  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1357  gp30  40.1 
 
 
245 aa  132  3e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.200548  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53650  hypothetical protein  45.27 
 
 
148 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00626606  hitchhiker  0.000571766 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0118  gp30  38.95 
 
 
249 aa  118  7e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.427468  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2001  gp30  36.22 
 
 
244 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.274125  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0643  VRR-NUC domain-containing protein  36.62 
 
 
255 aa  85.5  7e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0212  VRR-NUC domain-containing protein  36.19 
 
 
256 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.143344  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3534  VRR-NUC domain protein  32.89 
 
 
449 aa  58.2  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3537  VRR-NUC domain protein  33.33 
 
 
449 aa  56.2  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0702  hypothetical protein  32.59 
 
 
251 aa  50.4  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0890  hypothetical protein  43.84 
 
 
334 aa  50.8  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.451004  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2141  hypothetical protein  28.89 
 
 
427 aa  43.1  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>