39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_01875 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_01875  lipoprotein  100 
 
 		 181 aa  358  3e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.920687  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1377  rare lipoprotein B precursor  70.75 
 
 		 220 aa  221  6e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0925703  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1310  rare lipoprotein B  67.09 
 
 		 202 aa  220  9.999999999999999e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2911  Rare lipoprotein B  70.78 
 
 		 194 aa  209  2e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.398156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2664  rare lipoprotein B  29.29 
 
 		 161 aa  64.3  0.0000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.167141  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0543  rare lipoprotein B  28.89 
 
 		 172 aa  56.2  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.263488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0576  rare lipoprotein B  32.14 
 
 		 183 aa  51.2  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0550  rare lipoprotein B  32.14 
 
 		 183 aa  50.8  0.000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.951717  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1201  Rare lipoprotein B  26.23 
 
 		 175 aa  50.8  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.877221  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1212  putative lipoprotein  31.46 
 
 		 176 aa  49.7  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0477  rare lipoprotein B  27.03 
 
 		 213 aa  49.7  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.421577  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0172  rare lipoprotein B  29.76 
 
 		 176 aa  47.8  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0655  rare lipoprotein B  29.76 
 
 		 176 aa  47.8  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.36505  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0989  rare lipoprotein B precursor  26.92 
 
 		 210 aa  47  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.193759  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0622  rare lipoprotein B  29.76 
 
 		 183 aa  47.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.696129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3480  rare lipoprotein B  26.45 
 
 		 164 aa  47  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0408224  hitchhiker  0.000000129712 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3414  putative lipoprotein  30.34 
 
 		 183 aa  46.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2731  rare lipoprotein B  29.76 
 
 		 176 aa  46.6  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.255924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2639  putative lipoprotein  30.34 
 
 		 183 aa  46.2  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3449  putative lipoprotein  30.34 
 
 		 183 aa  46.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1228  putative lipoprotein  30.34 
 
 		 183 aa  46.2  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2452  putative lipoprotein  30.34 
 
 		 183 aa  46.2  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3450  putative lipoprotein  30.34 
 
 		 176 aa  46.6  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.978876  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3741  rare lipoprotein B  28.57 
 
 		 177 aa  46.2  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0664658 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0369  putative lipoprotein  30.34 
 
 		 183 aa  46.2  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3785  rare lipoprotein B  28.45 
 
 		 171 aa  45.8  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.202696  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1452  rare lipoprotein B  24.07 
 
 		 172 aa  45.8  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.334843  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2583  rare lipoprotein B  25.71 
 
 		 164 aa  45.8  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.259622  normal  0.446935 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3703  rare lipoprotein B  28.69 
 
 		 164 aa  45.1  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00988017  hitchhiker  0.0000022488 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0512  rare lipoprotein B  29.75 
 
 		 170 aa  45.1  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2972  rare lipoprotein B  26.55 
 
 		 171 aa  45.1  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0796  rare lipoprotein B  25.74 
 
 		 165 aa  44.7  0.0008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.256578  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2930  rare lipoprotein B  26.19 
 
 		 164 aa  44.7  0.0008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.692064  decreased coverage  0.00636409 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2587  rare lipoprotein B  28.89 
 
 		 183 aa  44.3  0.0009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.890824  hitchhiker  0.0000000000573442 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6002  rare lipoprotein B  28.28 
 
 		 168 aa  44.3  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.13554 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0704  rare lipoprotein B  25.74 
 
 		 169 aa  43.5  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00180129  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0577  rare lipoprotein B  28.89 
 
 		 169 aa  43.1  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.330293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3379  rare lipoprotein B  28.89 
 
 		 183 aa  42.4  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000235513 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2864  rare lipoprotein B  28.1 
 
 		 164 aa  41.6  0.006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.012268  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>