19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_5470 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_5470  hypothetical protein  100 
 
 		 181 aa  374  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5025  hypothetical protein  85.6 
 
 		 125 aa  223  1e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.665825 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4400  hypothetical protein  71.77 
 
 		 131 aa  198  3e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.188798 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5360  hypothetical protein  72.58 
 
 		 124 aa  196  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.693226  normal  0.324746 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5312  hypothetical protein  71.77 
 
 		 124 aa  195  3e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.828219  normal  0.0468247 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5221  hypothetical protein  70.97 
 
 		 124 aa  194  8.000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.568933  normal  0.611429 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5561  hypothetical protein  78.69 
 
 		 128 aa  187  8e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70590  hypothetical protein  65.25 
 
 		 130 aa  176  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6124  hypothetical protein  65.25 
 
 		 130 aa  175  3e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0161  hypothetical protein  71.05 
 
 		 125 aa  175  3e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.323889  normal  0.24707 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0312  hypothetical protein  42.62 
 
 		 132 aa  107  9.000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4733  hypothetical protein  42.62 
 
 		 132 aa  106  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.760088 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1169  hypothetical protein  39.83 
 
 		 118 aa  95.9  3e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1860  hypothetical protein  31.03 
 
 		 168 aa  64.7  0.0000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2149  hypothetical protein  30.17 
 
 		 168 aa  63.2  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2186  hypothetical protein  28.18 
 
 		 189 aa  62.4  0.000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0146743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3248  hypothetical protein  33.33 
 
 		 119 aa  48.9  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1325  hypothetical protein  24.14 
 
 		 118 aa  44.3  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5286  molybdopterin oxidoreductase  21.1 
 
 		 992 aa  42.7  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>