12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_4954 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



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Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4954  hypothetical protein  100 
 
 		 511 aa  1035    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0560  hypothetical protein  93.54 
 
 		 511 aa  953    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0511  signal transduction protein  63.15 
 
 		 512 aa  639    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.84731  normal  0.814528 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4698  metal-dependent hydrolase HDOD  62.48 
 
 		 511 aa  584  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4906  metal-dependent hydrolase HDOD  62.67 
 
 		 511 aa  580  1e-164  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4782  metal-dependent hydrolase HDOD  62.48 
 
 		 511 aa  578  1e-164  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4959  metal-dependent hydrolase HDOD  62.08 
 
 		 511 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.840319 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0623  HDOD  55.31 
 
 		 507 aa  548  1e-154  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65470  hypothetical protein  53.02 
 
 		 503 aa  491  1e-137  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5684  HDOD domain-contain protein  52.82 
 
 		 503 aa  491  1e-137  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2642  metal-dependent hydrolase HDOD  21.61 
 
 		 492 aa  47  0.0008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.994556  hitchhiker  0.000160222 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0716  putative signal transduction protein  25.5 
 
 		 276 aa  45.8  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.670911  normal  0.515332 
 
 
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