15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3653 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3653    100 
 
 		 210 bp  416  1e-114  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0544552  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3223  IS52, transposase  100 
 
 		 978 bp  369  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.199078  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3528  IS52, transposase  100 
 
 		 978 bp  369  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.418337  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3614    100 
 
 		 951 bp  369  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.217633  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4725  IS52, transposase  100 
 
 		 978 bp  369  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0436  transposase IS4 family protein  86.67 
 
 		 981 bp  56  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0489496  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0909  transposase IS4 family protein  86.67 
 
 		 981 bp  56  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2101  transposase IS4 family protein  86.67 
 
 		 981 bp  56  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3025  transposase IS4 family protein  86.67 
 
 		 981 bp  56  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.965699  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0041  hypothetical protein  100 
 
 		 387 bp  48.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0841    100 
 
 		 465 bp  48.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2838  hypothetical protein  100 
 
 		 423 bp  48.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0102813  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2969  hypothetical protein  100 
 
 		 489 bp  48.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0448916  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3214    100 
 
 		 1719 bp  48.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.34775  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4996  hypothetical protein  100 
 
 		 2922 bp  48.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>