43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2068 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



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Replicon accession
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Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
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E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2068  hypothetical protein  100 
 
 		 109 aa  226  9e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.283798  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1877  EthD  96.3 
 
 		 109 aa  217  5e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4718  Ethyl tert-butyl ether degradation EthD  59.41 
 
 		 104 aa  139  9e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00821  ethyl tert-butyl ether degradation EthD  60.4 
 
 		 119 aa  131  3.9999999999999996e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0976137  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7247  ethyl tert-butyl ether degradation protein, EthD  54.46 
 
 		 108 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.229987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3441  Ethyl tert-butyl ether degradation EthD  53.47 
 
 		 108 aa  127  6e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3094  Ethyl tert-butyl ether degradation EthD  53.47 
 
 		 108 aa  127  6e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5990  ethyl tert-butyl ether degradation EthD  54.46 
 
 		 108 aa  126  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2087  ethyl tert-butyl ether degradation EthD  54.46 
 
 		 108 aa  126  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.266224  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2106  ethyl tert-butyl ether degradation EthD  54.46 
 
 		 108 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.844968  normal  0.217375 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1972  ethyl tert-butyl ether degradation EthD  54.46 
 
 		 108 aa  125  3e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.113756  normal  0.906613 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6225  Ethyl tert-butyl ether degradation EthD  50.5 
 
 		 108 aa  120  4e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5694  ethyl tert-butyl ether degradation EthD  50.5 
 
 		 108 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0707  Ethyl tert-butyl ether degradation EthD  45.54 
 
 		 104 aa  113  6.9999999999999995e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0206  normal  0.431639 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2708  ethyl tert-butyl ether degradation EthD  48.51 
 
 		 103 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3870  ethyl tert-butyl ether degradation EthD  43.69 
 
 		 107 aa  105  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5978  Ethyl tert-butyl ether degradation EthD  44.55 
 
 		 104 aa  105  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3112  Ethyl tert-butyl ether degradation EthD  48.57 
 
 		 106 aa  94  6e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0608  ethyl tert-butyl ether degradation EthD  44.76 
 
 		 106 aa  93.2  9e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0881  hypothetical protein  47.62 
 
 		 106 aa  89.7  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.87022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2223  Ethyl tert-butyl ether degradation EthD  33.66 
 
 		 131 aa  87  8e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.260366 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5139  Ethyl tert-butyl ether degradation EthD  35.64 
 
 		 142 aa  85.5  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.249739  hitchhiker  0.00632638 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3594  ethyl tert-butyl ether degradation EthD  35.92 
 
 		 103 aa  68.6  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1640  ethyl tert-butyl ether degradation EthD  35.64 
 
 		 111 aa  67.4  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0576877 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0177  ethyl tert-butyl ether degradation EthD  34.62 
 
 		 103 aa  65.1  0.0000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4538  ethyl tert-butyl ether degradation EthD  37.96 
 
 		 105 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2764  Ethyl tert-butyl ether degradation EthD  41.12 
 
 		 108 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.384279 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1013  Ethyl tert-butyl ether degradation EthD  32.67 
 
 		 101 aa  62.4  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0686  ethyl tert-butyl ether degradation EthD  36.27 
 
 		 103 aa  61.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.761017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3503  ethyl tert-butyl ether degradation EthD  31 
 
 		 104 aa  58.9  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.358268 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4472  Ethyl tert-butyl ether degradation EthD  39.25 
 
 		 105 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2641  ethyl tert-butyl ether degradation EthD  40.19 
 
 		 108 aa  57  0.00000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.444029  normal  0.676741 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2867  Ethyl tert-butyl ether degradation EthD  40.19 
 
 		 108 aa  57  0.00000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.169776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2334  Ethyl tert-butyl ether degradation EthD  28.43 
 
 		 100 aa  55.5  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00612684  normal  0.644511 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3458  Ethyl tert-butyl ether degradation EthD  29.41 
 
 		 100 aa  51.6  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3681  ethyl tert-butyl ether degradation EthD  32.67 
 
 		 103 aa  50.8  0.000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.401382 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6287  ethyl tert-butyl ether degradation EthD  33.33 
 
 		 102 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0769  ethyl tert-butyl ether degradation EthD  27.72 
 
 		 106 aa  42.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.500812 
 
 
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NC_010506  Swoo_0215  ethyl tert-butyl ether degradation EthD  24.77 
 
 		 111 aa  41.2  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587315 
 
 
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NC_013132  Cpin_0277  hypothetical protein  31.25 
 
 		 455 aa  41.2  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010335  Caul_5271  ethyl tert-butyl ether degradation EthD  29 
 
 		 113 aa  40.8  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.357656  hitchhiker  0.000208925 
 
 
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NC_008544  Bcen2424_6690  ethyl tert-butyl ether degradation EthD  31.25 
 
 		 102 aa  40.4  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008062  Bcen_6455  ethyl tert-butyl ether degradation EthD  31.25 
 
 		 102 aa  40.4  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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