24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_0873 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0873  amidinotransferase family protein  100 
 
 		 366 aa  759    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3009  Non-specific serine/threonine protein kinase  46.35 
 
 		 364 aa  338  9.999999999999999e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.169976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1964  non-specific serine/threonine protein kinase  45.22 
 
 		 391 aa  319  3.9999999999999996e-86  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6335  non-specific serine/threonine protein kinase  45.43 
 
 		 409 aa  317  3e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00816839 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2321  amidinotransferase  46.09 
 
 		 386 aa  312  6.999999999999999e-84  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.187783  normal  0.819339 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3760  Non-specific serine/threonine protein kinase  43.8 
 
 		 397 aa  309  5.9999999999999995e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.408219  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3451  non-specific serine/threonine protein kinase  43.53 
 
 		 397 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.103765 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3649  Non-specific serine/threonine protein kinase  44.11 
 
 		 393 aa  306  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0815674 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7150  amidinotransferase  43.78 
 
 		 395 aa  306  3e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.864605  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0977  non-specific serine/threonine protein kinase  43.49 
 
 		 391 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0016  glycine amidinotransferase  38.65 
 
 		 369 aa  228  1e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0416  Glycine amidinotransferase  38.25 
 
 		 380 aa  227  2e-58  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2021  Scyllo-inosamine-4-phosphate amidinotransferase  35.05 
 
 		 361 aa  213  3.9999999999999995e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.962087  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01930  N-dimethylarginine dimethylaminohydrolase  34.43 
 
 		 382 aa  194  2e-48  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.47448 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0143  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.52 
 
 		 382 aa  179  4.999999999999999e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1163  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.52 
 
 		 382 aa  179  4.999999999999999e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.942242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3130  glycine amidinotransferase  30.73 
 
 		 379 aa  164  2.0000000000000002e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.189552  normal  0.888288 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2444  Scyllo-inosamine-4-phosphate amidinotransferase  30.34 
 
 		 375 aa  164  3e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.829074  normal  0.128556 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1716  scyllo-inosamine-4-phosphate amidinotransferase  30.49 
 
 		 384 aa  160  2e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.528511  normal  0.723932 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2924  scyllo-inosamine-4-phosphate amidinotransferase  29.59 
 
 		 384 aa  159  7e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14361  hypothetical protein  29.45 
 
 		 401 aa  156  6e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.276256  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0821  arginine deiminase  22.54 
 
 		 319 aa  77.4  0.0000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.208764  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6526  putative amidinotransferase family protein  23.4 
 
 		 333 aa  73.2  0.000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2108  amidinotransferase  23.02 
 
 		 323 aa  66.2  0.0000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>