11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_0688 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0688  lipoprotein, putative  100 
 
 		 149 aa  288  1e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4464  putative lipoprotein  91.95 
 
 		 149 aa  243  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5021  hypothetical protein  78.5 
 
 		 154 aa  164  5e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.896625 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0565  hypothetical protein  60 
 
 		 150 aa  159  1e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.935311 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0512  hypothetical protein  73.15 
 
 		 194 aa  155  1e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0547  hypothetical protein  66.92 
 
 		 158 aa  155  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0558  hypothetical protein  71.96 
 
 		 150 aa  152  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06690  hypothetical protein  50.99 
 
 		 147 aa  115  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.804446  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11370  putative lipoprotein  47.14 
 
 		 156 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0255476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1043  putative lipoprotein  52.63 
 
 		 152 aa  103  6e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.495936  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3859  hypothetical protein  49.07 
 
 		 150 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>