15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_0282 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0282  hypothetical protein  100 
 
 		 226 aa  421  1e-117  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.140821  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0115  hypothetical protein  91.15 
 
 		 254 aa  348  3e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.973044 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2861  hypothetical protein  69.91 
 
 		 258 aa  275  3e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.613567  normal  0.192183 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2011  hypothetical protein  53.39 
 
 		 254 aa  201  7e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3192  hypothetical protein  52.94 
 
 		 254 aa  197  9e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157621  normal  0.129544 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2527  hypothetical protein  52.94 
 
 		 293 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.35785  normal  0.669591 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0967  hypothetical protein  38.1 
 
 		 260 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0247  hypothetical protein  33.8 
 
 		 258 aa  81.6  0.000000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.92599 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1483  hypothetical protein  31.05 
 
 		 250 aa  80.5  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4569  hypothetical protein  28.73 
 
 		 241 aa  74.7  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2427  hypothetical protein  33.72 
 
 		 265 aa  56.6  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1830  hypothetical protein  27.87 
 
 		 284 aa  55.5  0.0000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2069  hypothetical protein  30 
 
 		 277 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0297  hypothetical protein  25.89 
 
 		 284 aa  50.1  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.246483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2627  hypothetical protein  26.75 
 
 		 269 aa  43.5  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.433366 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>