20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_6124 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_6124  hypothetical protein  100 
 
 
130 aa  266  8e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70590  hypothetical protein  96.61 
 
 
130 aa  238  2e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4400  hypothetical protein  76.34 
 
 
131 aa  209  1e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.188798 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5360  hypothetical protein  73.17 
 
 
124 aa  196  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.693226  normal  0.324746 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5312  hypothetical protein  72.36 
 
 
124 aa  194  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.828219  normal  0.0468247 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5221  hypothetical protein  70.73 
 
 
124 aa  191  2e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.568933  normal  0.611429 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5470  hypothetical protein  66.94 
 
 
181 aa  186  7e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5025  hypothetical protein  69.35 
 
 
125 aa  185  2e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.665825 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0161  hypothetical protein  70.43 
 
 
125 aa  176  1e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.323889  normal  0.24707 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5561  hypothetical protein  72.22 
 
 
128 aa  171  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0312  hypothetical protein  36.07 
 
 
132 aa  93.6  8e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1169  hypothetical protein  37.29 
 
 
118 aa  92.4  2e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4733  hypothetical protein  36.07 
 
 
132 aa  89.7  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.760088 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2186  hypothetical protein  31.9 
 
 
189 aa  63.5  0.0000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0146743  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2149  hypothetical protein  29.06 
 
 
168 aa  60.5  0.000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1860  hypothetical protein  28.21 
 
 
168 aa  57.4  0.00000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5286  molybdopterin oxidoreductase  22.22 
 
 
992 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3526  molybdopterin oxidoreductase  23.85 
 
 
992 aa  51.6  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.286142  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3248  hypothetical protein  33.33 
 
 
119 aa  48.1  0.00004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1325  hypothetical protein  23.28 
 
 
118 aa  42.4  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>