53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4955 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4955  hypothetical protein  100 
 
 
228 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.592135  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56990  hypothetical protein  85.96 
 
 
228 aa  407  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0706  hypothetical protein  38.42 
 
 
218 aa  107  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0154953  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2214  hypothetical protein  36.13 
 
 
198 aa  106  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0189524  normal  0.582651 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3524  hypothetical protein  36.79 
 
 
208 aa  101  8e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.940039  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3351  hypothetical protein  36.22 
 
 
207 aa  99.8  3e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.789599  normal  0.0806703 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4378  hypothetical protein  34.02 
 
 
217 aa  96.3  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0750226  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0740  Putative ParB-like nuclease  34.02 
 
 
205 aa  96.3  4e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2350  Putative ParB-like nuclease  34.02 
 
 
199 aa  95.1  8e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.309294  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0727  putative ParB-like nuclease  33.51 
 
 
205 aa  94.4  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.215897  normal  0.881395 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0701  Putative ParB-like nuclease  32.84 
 
 
205 aa  93.6  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2235  Putative ParB-like nuclease  34.09 
 
 
207 aa  93.2  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4374  hypothetical protein  32.51 
 
 
226 aa  91.3  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.093636  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4261  putative ParB-like nuclease  35.29 
 
 
205 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1460  putative ParB-like nuclease  36.41 
 
 
208 aa  90.5  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.530245  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2187  putative ParB-like nuclease  32.11 
 
 
205 aa  90.1  3e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0352754  normal  0.506463 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1058  hypothetical protein  37.95 
 
 
208 aa  89.7  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1420  hypothetical protein  36.41 
 
 
208 aa  90.1  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1538  hypothetical protein  37.95 
 
 
208 aa  89.7  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0136  hypothetical protein  35.26 
 
 
208 aa  89.4  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1271  hypothetical protein  35.26 
 
 
208 aa  89.4  4e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.335245  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1788  hypothetical protein  35.26 
 
 
208 aa  89.4  4e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.185204  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1809  hypothetical protein  35.26 
 
 
208 aa  89.4  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1030  hypothetical protein  35.26 
 
 
208 aa  89.4  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.738741  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1716  putative ParB-like nuclease  37.44 
 
 
208 aa  89.4  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00172084 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1759  hypothetical protein  35.26 
 
 
208 aa  89.4  4e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.342395  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1961  hypothetical protein  37.44 
 
 
443 aa  89.7  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0136529  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1514  putative ParB-like nuclease  35.79 
 
 
208 aa  89  6e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.865325  hitchhiker  0.00751547 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2660  putative ParB-like nuclease  33.17 
 
 
212 aa  88.2  9e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.683597  normal  0.548694 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4678  hypothetical protein  36.55 
 
 
208 aa  87.8  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0352084  normal  0.199717 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2525  hypothetical protein  34.74 
 
 
208 aa  87.8  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0224585  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1668  hypothetical protein  31.4 
 
 
206 aa  87.8  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0409439 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0887  hypothetical protein  29.22 
 
 
222 aa  85.5  6e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0704  hypothetical protein  32.29 
 
 
205 aa  84.3  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.15967  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0974  hypothetical protein  29.8 
 
 
222 aa  84.7  0.000000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13631  hypothetical protein  31.96 
 
 
216 aa  83.2  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0880  Putative ParB-like nuclease  33.12 
 
 
205 aa  80.9  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.141868 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4518  putative ParB-like nuclease  30.73 
 
 
208 aa  79.7  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05691  hypothetical protein  25.69 
 
 
255 aa  78.2  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.222417  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5254  putative ParB-like nuclease  34.02 
 
 
203 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0513173 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0203  hypothetical protein  37.29 
 
 
378 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0686  hypothetical protein  37.29 
 
 
378 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3772  hypothetical protein  37.29 
 
 
378 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0653  putative ParB-like nuclease  36.44 
 
 
378 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.488055  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2067  putative ParB-like nuclease  35.29 
 
 
305 aa  64.7  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2351  putative lipoprotein  32.06 
 
 
380 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2530  putative lipoprotein  32.06 
 
 
380 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0264  putative lipoprotein  32.06 
 
 
380 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1126  putative lipoprotein  32.06 
 
 
380 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1245  putative lipoprotein  34.75 
 
 
380 aa  62  0.000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3403  putative lipoprotein  31.3 
 
 
380 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3409  putative lipoprotein  31.3 
 
 
380 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3368  putative lipoprotein  30.53 
 
 
380 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>