13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_3171 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_3171  putative metallothionein  100 
 
 
79 aa  158  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36890  putative metallothionein  96.2 
 
 
79 aa  153  7e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0397496  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2649  metallothionein  53.16 
 
 
76 aa  83.6  9e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3262  metallothionein, putative  54.43 
 
 
74 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2499  metallothionein family protein  54.43 
 
 
74 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3014  metallothionein  51.9 
 
 
76 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.797789 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0887  metallothionein family 14  46.67 
 
 
57 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.797466 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0861  metallothionein family 14  46.67 
 
 
57 aa  42  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0440  metallothionein family 14  51.06 
 
 
58 aa  42.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.711747  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0149  metallothionein, family protein  46.67 
 
 
76 aa  42  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2545  metallothionein family 14  46.67 
 
 
55 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2070  metallothionein family protein  48.94 
 
 
58 aa  40.8  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.106237  hitchhiker  0.00805122 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2843  metallothionein family protein  42.31 
 
 
76 aa  40  0.01  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>