18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_2551 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_2551  hypothetical protein  100 
 
 
282 aa  580  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.569543  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4795  VTC domain protein  38.86 
 
 
286 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3226  hypothetical protein  37.89 
 
 
260 aa  124  2e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4902  major facilitator superfamily MFS_1  36.56 
 
 
735 aa  107  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283889  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1490  hypothetical protein  34.15 
 
 
280 aa  106  5e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00472854  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2816  hypothetical protein  32.79 
 
 
280 aa  105  9e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.850496  normal  0.117203 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1332  hypothetical protein  36.89 
 
 
251 aa  104  1e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13050  VTC domain-containing protein  34.43 
 
 
259 aa  102  9e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1573  VTC domain protein  35.66 
 
 
294 aa  101  1e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.375137  hitchhiker  0.00558819 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1904  hypothetical protein  34.43 
 
 
265 aa  95.9  7e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0852  hypothetical protein  36.49 
 
 
277 aa  95.5  8e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.538253  normal  0.0167402 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3221  hypothetical protein  35.27 
 
 
281 aa  94.7  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03050  VTC domain-containing protein  34.13 
 
 
283 aa  94.7  1e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3209  hypothetical protein  37.83 
 
 
268 aa  87.4  2e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.435311  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3873  hypothetical protein  27.06 
 
 
267 aa  87  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.212389 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3117  hypothetical protein  33.61 
 
 
265 aa  80.1  0.00000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0313259  normal  0.140705 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1555  hypothetical protein  25.33 
 
 
231 aa  51.6  0.00001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0170408  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4918  hypothetical protein  27.21 
 
 
299 aa  44.3  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>