11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_1043 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_1043  putative lipoprotein  100 
 
 		 152 aa  293  5e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.495936  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11370  putative lipoprotein  94.74 
 
 		 156 aa  263  5.999999999999999e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0255476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0547  hypothetical protein  52.9 
 
 		 158 aa  120  8e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0565  hypothetical protein  53.47 
 
 		 150 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.935311 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5021  hypothetical protein  57.14 
 
 		 154 aa  118  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.896625 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4464  putative lipoprotein  49.04 
 
 		 149 aa  117  7e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0558  hypothetical protein  51.08 
 
 		 150 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0512  hypothetical protein  56.25 
 
 		 194 aa  114  5e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0688  lipoprotein, putative  52.63 
 
 		 149 aa  105  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06690  hypothetical protein  42.55 
 
 		 147 aa  79.3  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.804446  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3859  hypothetical protein  43.96 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>