12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_2991 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2991  hypothetical protein  100 
 
 		 343 aa  704    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.25392  normal  0.162445 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2701  hypothetical protein  98.05 
 
 		 308 aa  623  1e-177  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3220  hypothetical protein  63.39 
 
 		 350 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.111198  normal  0.590699 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5682  hypothetical protein  32.78 
 
 		 305 aa  150  4e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6046  hypothetical protein  32.78 
 
 		 305 aa  150  4e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.209796 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6532  hypothetical protein  32.44 
 
 		 305 aa  149  6e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.600374  normal  0.079973 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7477  hypothetical protein  32.44 
 
 		 305 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1698  hypothetical protein  39.23 
 
 		 304 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.10247  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2823  hypothetical protein  34.75 
 
 		 304 aa  142  9e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4673  hypothetical protein  32.34 
 
 		 290 aa  122  6e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3725  hypothetical protein  26.8 
 
 		 254 aa  55.5  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5528  hypothetical protein  33.72 
 
 		 100 aa  50.1  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.253992 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>