15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_1196 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1196  hypothetical protein  100 
 
 		 251 aa  509  1e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.161366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1227  hypothetical protein  99.6 
 
 		 249 aa  502  1e-141  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0996282  normal  0.630416 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4220  hypothetical protein  93.17 
 
 		 249 aa  474  1e-133  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.596689 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0829  hypothetical protein  35.47 
 
 		 261 aa  122  7e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1691  hypothetical protein  33.78 
 
 		 281 aa  115  6e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2064  hypothetical protein  25.7 
 
 		 296 aa  76.3  0.0000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000220233 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2158  hypothetical protein  24.65 
 
 		 296 aa  69.3  0.00000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0467  hypothetical protein  26.1 
 
 		 293 aa  65.9  0.0000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.151068  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1755  hypothetical protein  27.06 
 
 		 230 aa  66.2  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.071754  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3413  hypothetical protein  25.09 
 
 		 285 aa  59.3  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0120615  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0203  hypothetical protein  24.41 
 
 		 270 aa  57.8  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0772  hypothetical protein  25.91 
 
 		 261 aa  54.3  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0620  hypothetical protein  25.91 
 
 		 261 aa  54.3  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.228252  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2020  hypothetical protein  21.01 
 
 		 293 aa  49.3  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00123308  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2939  hypothetical protein  25 
 
 		 290 aa  47.4  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000256783  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>