29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_0700 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007577  PMT9312_0700  high light inducible protein-like  100 
 
 
84 aa  169  2e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.15579  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07481  high light inducible protein  85.71 
 
 
84 aa  153  8e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.274779  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07501  high light inducible protein  84.52 
 
 
84 aa  150  5e-36  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08871  high light inducible protein  65.48 
 
 
84 aa  120  5e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.799327  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17461  high light inducible protein  73.53 
 
 
42 aa  62.4  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.528632  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08891  high light inducible protein  73.53 
 
 
42 aa  62.4  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1508  high light inducible protein-like  72.73 
 
 
42 aa  62  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.945856  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11661  hypothetical protein  74.29 
 
 
39 aa  61.2  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.120143 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13201  high light inducible protein  60 
 
 
42 aa  60.5  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.387322  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0686  high light inducible protein-like  60 
 
 
42 aa  60.1  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0417  high light inducible protein  66.67 
 
 
39 aa  58.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13061  high light inducible protein  60 
 
 
42 aa  59.3  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11141  hypothetical protein  66.67 
 
 
41 aa  59.3  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.242488  hitchhiker  0.00189562 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1230  high light inducible protein-like  57.5 
 
 
42 aa  58.5  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04361  hypothetical protein  61.11 
 
 
41 aa  53.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.354033  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_13551  hypothetical protein  61.11 
 
 
41 aa  53.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.168201 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_13161  hypothetical protein  61.11 
 
 
41 aa  53.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.27545 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0602  high light inducible protein  61.11 
 
 
41 aa  53.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.220057  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1718  high light inducible protein  61.11 
 
 
41 aa  53.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0551  high light inducible protein  61.11 
 
 
41 aa  52.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.00877549  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_12351  hypothetical protein  61.11 
 
 
41 aa  52.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14091  hypothetical protein  61.11 
 
 
41 aa  52.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.135077  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0507  high light inducible protein  61.11 
 
 
41 aa  52.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.320357  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12411  high light inducible protein  43.75 
 
 
84 aa  50.8  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12601  high light inducible protein  46.88 
 
 
84 aa  50.4  0.000009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.408984  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12661  hypothetical protein  45.31 
 
 
84 aa  50.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.17207  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1173  high light inducible protein-like  58.54 
 
 
84 aa  49.7  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.360443  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04201  high light inducible protein  32.18 
 
 
86 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11651  hypothetical protein  42.86 
 
 
67 aa  40  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.12269 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>