72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_0192 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007577  PMT9312_0192  hypothetical protein  100 
 
 
147 aa  288  1e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.373494  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02081  hypothetical protein  96.6 
 
 
147 aa  280  5.000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.235056  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02101  hypothetical protein  95.92 
 
 
147 aa  278  2e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0337781  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02191  hypothetical protein  64.63 
 
 
150 aa  184  4e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1557  hypothetical protein  51.88 
 
 
151 aa  147  6e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02661  hypothetical protein  51.88 
 
 
151 aa  145  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27551  hypothetical protein  51.09 
 
 
167 aa  140  8e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2137  hypothetical protein  42.75 
 
 
162 aa  119  9.999999999999999e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2454  hypothetical protein  44.2 
 
 
146 aa  118  1.9999999999999998e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02081  hypothetical protein  54.4 
 
 
149 aa  117  7e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.817359  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1583  hypothetical protein  50.96 
 
 
178 aa  97.4  5e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4776  hypothetical protein  41.74 
 
 
187 aa  96.3  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3779  hypothetical protein  37.93 
 
 
159 aa  83.2  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0470  hypothetical protein  43.96 
 
 
200 aa  72.4  0.000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0466774  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2062  hypothetical protein  33.06 
 
 
173 aa  71.6  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.687582  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0502  hypothetical protein  35.77 
 
 
210 aa  66.6  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000282211 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2870  hypothetical protein  29.63 
 
 
208 aa  66.2  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0163842 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2465  hypothetical protein  45.31 
 
 
169 aa  64.3  0.0000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000697447  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0390  hypothetical protein  30.22 
 
 
160 aa  63.2  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.371828  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1362  hypothetical protein  31.65 
 
 
171 aa  63.2  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3780  uncharacterized protein-like protein  32.62 
 
 
160 aa  62  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0161725  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1849  hypothetical protein  41.33 
 
 
165 aa  62.4  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3130  hypothetical protein  29.55 
 
 
160 aa  60.8  0.000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0121568  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1079  glycosyl transferase family protein  32.26 
 
 
395 aa  60.8  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3864  uncharacterized protein-like protein  30.82 
 
 
160 aa  60.5  0.000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4133  hypothetical protein  30.65 
 
 
160 aa  58.5  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000340149  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1438  hypothetical protein  36 
 
 
196 aa  56.6  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.244282  normal  0.395476 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1383  hypothetical protein  27.59 
 
 
180 aa  55.8  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2148  hypothetical protein  28.46 
 
 
171 aa  55.5  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.446802 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1745  hypothetical protein  31.97 
 
 
163 aa  55.8  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0515  hypothetical protein  25.52 
 
 
210 aa  53.9  0.0000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0790  hypothetical protein  29.03 
 
 
197 aa  53.1  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0872806  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0526  hypothetical protein  28.23 
 
 
165 aa  53.1  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.983156  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0956  hypothetical protein  32.8 
 
 
179 aa  53.1  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2731  hypothetical protein  30.34 
 
 
176 aa  53.5  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0195  hypothetical protein  37.68 
 
 
218 aa  52  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0784  hypothetical protein  28.67 
 
 
197 aa  51.6  0.000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.11051  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2630  hypothetical protein  30.67 
 
 
191 aa  51.2  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.662517  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3586  hypothetical protein  32.89 
 
 
165 aa  51.2  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000285245  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4179  hypothetical protein  25.42 
 
 
172 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.764127 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1250  hypothetical protein  38.46 
 
 
186 aa  50.1  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1584  hypothetical protein  25.42 
 
 
185 aa  50.1  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.452951  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1507  hypothetical protein  25.23 
 
 
208 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1610  hypothetical protein  26.96 
 
 
175 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0380399  normal  0.147771 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2626  hypothetical protein  31.25 
 
 
198 aa  48.9  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3818  hypothetical protein  24.14 
 
 
210 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0651  hypothetical protein  28.57 
 
 
190 aa  48.9  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.849018  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0658  hypothetical protein  28.57 
 
 
190 aa  48.9  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.381208  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14720  hypothetical protein  25.2 
 
 
175 aa  47.4  0.00006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00102497  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1855  hypothetical protein  30.67 
 
 
210 aa  47.4  0.00007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1399  hypothetical protein  36.92 
 
 
218 aa  46.2  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.313439 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25470  hypothetical protein  25.2 
 
 
177 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0480  glycosyl transferase family 2  29.23 
 
 
377 aa  46.6  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0370888  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1214  hypothetical protein  40.98 
 
 
188 aa  46.6  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2507  hypothetical protein  33.61 
 
 
198 aa  46.6  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.792495  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5943  hypothetical protein  32.31 
 
 
177 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0572526  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0679  hypothetical protein  29.2 
 
 
210 aa  45.4  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1201  Protein of unknown function DUF2062  30.36 
 
 
188 aa  45.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0952689 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0394  hypothetical protein  38.57 
 
 
180 aa  45.1  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2176  hypothetical protein  25.2 
 
 
177 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2564  hypothetical protein  27.78 
 
 
234 aa  43.9  0.0007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.164456  hitchhiker  0.00170184 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2833  hypothetical protein  28.57 
 
 
182 aa  43.9  0.0008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0982426  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1367  hypothetical protein  33.33 
 
 
174 aa  43.5  0.0009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0557  hypothetical protein  28.23 
 
 
171 aa  42  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.235942  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1643  Protein of unknown function DUF2062  30.13 
 
 
163 aa  42  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2671  hypothetical protein  35.38 
 
 
178 aa  41.6  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1472  hypothetical protein  25.23 
 
 
212 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1671  hypothetical protein  33.33 
 
 
218 aa  41.2  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0304  hypothetical protein  33.33 
 
 
218 aa  41.2  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.785913  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1989  hypothetical protein  29.35 
 
 
178 aa  40.8  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0947  hypothetical protein  26.92 
 
 
177 aa  40.8  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0658  Protein of unknown function DUF2062  28.7 
 
 
179 aa  40.4  0.008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>