75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1557 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1557  hypothetical protein  100 
 
 
151 aa  303  4.0000000000000004e-82  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02661  hypothetical protein  98.01 
 
 
151 aa  294  3e-79  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27551  hypothetical protein  48.28 
 
 
167 aa  164  5e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02101  hypothetical protein  53.38 
 
 
147 aa  149  1e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0337781  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02081  hypothetical protein  52.63 
 
 
147 aa  148  2e-35  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.235056  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0192  hypothetical protein  51.88 
 
 
147 aa  147  7e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.373494  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2137  hypothetical protein  44.52 
 
 
162 aa  142  2e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02081  hypothetical protein  52.74 
 
 
149 aa  139  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.817359  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2454  hypothetical protein  41.01 
 
 
146 aa  133  6.0000000000000005e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02191  hypothetical protein  50 
 
 
150 aa  119  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1583  hypothetical protein  41.32 
 
 
178 aa  102  1e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4776  hypothetical protein  40.52 
 
 
187 aa  101  3e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3779  hypothetical protein  38.33 
 
 
159 aa  89  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2062  hypothetical protein  36.11 
 
 
173 aa  84  7e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.687582  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0470  hypothetical protein  32.88 
 
 
200 aa  77  0.00000000000008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0466774  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0502  hypothetical protein  30.23 
 
 
210 aa  70.1  0.000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000282211 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1849  hypothetical protein  34.15 
 
 
165 aa  69.3  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2870  hypothetical protein  29.61 
 
 
208 aa  68.6  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0163842 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1362  hypothetical protein  29.31 
 
 
171 aa  68.2  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2465  hypothetical protein  39.53 
 
 
169 aa  68.2  0.00000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000697447  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3864  uncharacterized protein-like protein  28.79 
 
 
160 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0390  hypothetical protein  26.53 
 
 
160 aa  62  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.371828  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3780  uncharacterized protein-like protein  27.27 
 
 
160 aa  61.6  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0161725  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0526  hypothetical protein  24.11 
 
 
165 aa  60.5  0.000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.983156  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4133  hypothetical protein  27.54 
 
 
160 aa  59.3  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000340149  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3130  hypothetical protein  27.42 
 
 
160 aa  58.2  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0121568  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2564  hypothetical protein  26.09 
 
 
234 aa  57  0.00000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.164456  hitchhiker  0.00170184 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1745  hypothetical protein  31.62 
 
 
163 aa  55.8  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1133  hypothetical protein  27.91 
 
 
228 aa  55.5  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1584  hypothetical protein  27.87 
 
 
185 aa  53.1  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.452951  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2731  hypothetical protein  31.33 
 
 
176 aa  52.8  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2626  hypothetical protein  24.62 
 
 
198 aa  52.4  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3586  hypothetical protein  22.3 
 
 
165 aa  52.4  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000285245  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1438  hypothetical protein  43.55 
 
 
196 aa  52.4  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.244282  normal  0.395476 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0515  hypothetical protein  32.47 
 
 
210 aa  51.6  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03835  dolichyl-phosphate mannose synthase-like protein  28.37 
 
 
397 aa  51.6  0.000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.125771  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0195  hypothetical protein  29.49 
 
 
218 aa  50.8  0.000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1250  hypothetical protein  26.61 
 
 
186 aa  50.8  0.000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1855  hypothetical protein  31.58 
 
 
210 aa  48.9  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0790  hypothetical protein  40 
 
 
197 aa  47.8  0.00006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0872806  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2148  hypothetical protein  31.07 
 
 
171 aa  47.8  0.00006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.446802 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1507  hypothetical protein  28.04 
 
 
208 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0784  hypothetical protein  40 
 
 
197 aa  47.4  0.00008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.11051  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14720  hypothetical protein  29.84 
 
 
175 aa  47  0.00008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00102497  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0651  hypothetical protein  31.82 
 
 
190 aa  47  0.00009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.849018  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0658  hypothetical protein  31.82 
 
 
190 aa  47  0.00009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.381208  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2828  hypothetical protein  27.34 
 
 
159 aa  47  0.00009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0499107 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5943  hypothetical protein  26.67 
 
 
177 aa  47  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0572526  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25470  hypothetical protein  25.42 
 
 
177 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2176  hypothetical protein  25.47 
 
 
177 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3818  hypothetical protein  26.17 
 
 
210 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2630  hypothetical protein  30.23 
 
 
191 aa  45.8  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.662517  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0947  hypothetical protein  27.55 
 
 
177 aa  45.8  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1214  hypothetical protein  45 
 
 
188 aa  45.8  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1079  glycosyl transferase family protein  24.58 
 
 
395 aa  45.4  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0956  hypothetical protein  28.45 
 
 
179 aa  44.3  0.0005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0898  hypothetical protein  27.19 
 
 
169 aa  44.3  0.0006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.749286 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1386  hypothetical protein  31.82 
 
 
151 aa  44.3  0.0006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.01232  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0679  hypothetical protein  26.42 
 
 
210 aa  44.3  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1817  hypothetical protein  26.62 
 
 
168 aa  43.5  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0392533  normal  0.0810323 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003989  hypothetical protein  26.61 
 
 
169 aa  43.1  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0394  hypothetical protein  37.5 
 
 
180 aa  42.4  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1201  Protein of unknown function DUF2062  26.55 
 
 
188 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0952689 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0480  glycosyl transferase family 2  26.28 
 
 
377 aa  42.7  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0370888  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01533  hypothetical protein  26.61 
 
 
169 aa  42.4  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1367  hypothetical protein  24.58 
 
 
174 aa  42  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01852  flagellar biosynthesis protein FlhF  32.26 
 
 
174 aa  42  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.663944  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2833  hypothetical protein  33.73 
 
 
182 aa  41.2  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0982426  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1610  hypothetical protein  29.23 
 
 
175 aa  40.8  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0380399  normal  0.147771 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4179  hypothetical protein  25.66 
 
 
172 aa  40.4  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.764127 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1671  hypothetical protein  30.11 
 
 
218 aa  40.4  0.008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2163  putative membrane protein with signal peptide  27.91 
 
 
181 aa  40.4  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000423148  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0304  hypothetical protein  30.11 
 
 
218 aa  40.4  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.785913  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0633  hypothetical protein  23.93 
 
 
177 aa  40.4  0.009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1768  hypothetical protein  29.23 
 
 
168 aa  40  0.01  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.254976  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>