15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_86979 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009068  PICST_86979  vigilin  100 
 
 
1217 aa  2433    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02068  RNA binding effector protein Scp160, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04700)  25.76 
 
 
1305 aa  323  9.000000000000001e-87  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI02220  SCP160 protein, putative  25.99 
 
 
1289 aa  297  9e-79  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA06150  cytoplasm protein, putative  27.16 
 
 
1300 aa  57.4  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_56624  predicted protein  21.48 
 
 
1301 aa  57.4  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.187837  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4549  valyl-tRNA synthetase  29.93 
 
 
881 aa  45.4  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4355  valyl-tRNA synthetase  29.93 
 
 
881 aa  45.4  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4202  valyl-tRNA synthetase  29.93 
 
 
881 aa  45.4  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4690  valyl-tRNA synthetase  29.93 
 
 
881 aa  45.4  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4303  valyl-tRNA synthetase  29.61 
 
 
881 aa  45.8  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4591  valyl-tRNA synthetase  29.93 
 
 
881 aa  45.4  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4545  valyl-tRNA synthetase  29.93 
 
 
881 aa  45.4  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3174  valyl-tRNA synthetase  28.95 
 
 
881 aa  45.1  0.007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4576  valyl-tRNA synthetase  29.93 
 
 
881 aa  45.4  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0658  valyl-tRNA synthetase  29.93 
 
 
881 aa  45.4  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>