14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_81231 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001302  ANIA_08010  glycogen synthase (Eurofung)  70.2 
 
 
711 aa  1011    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.53633  normal  0.197205 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00590  glycogen (starch) synthase, putative  66.86 
 
 
733 aa  947    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81231  glycogen (starch) synthase  100 
 
 
699 aa  1460    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.490915  normal  0.0297098 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5697  Glycogen(starch) synthase  44.94 
 
 
606 aa  528  1e-148  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1581  glycogen synthase, glycosyltransferase family 3 protein  42.67 
 
 
604 aa  523  1e-147  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0619337  normal  0.0568049 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3735  Glycogen (starch) synthase  44.19 
 
 
604 aa  521  1e-146  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.860093 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1285  alpha-glucan phosphorylase  30.64 
 
 
1413 aa  270  5.9999999999999995e-71  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0468  alpha-glucan phosphorylase  28.74 
 
 
1421 aa  225  2e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.06142  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1042  glycogen synthase, putative  29.14 
 
 
548 aa  131  4.0000000000000003e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0023004 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1552  glycogen synthase  27.34 
 
 
594 aa  57.4  0.0000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.575386  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0296  hypothetical protein  27.82 
 
 
603 aa  54.3  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0433  hypothetical protein  33.87 
 
 
601 aa  50.8  0.00008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.430655  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0773  glycosyl transferase group 1  21.18 
 
 
457 aa  46.6  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1122  glycosyl transferase, group 1  27.97 
 
 
381 aa  44.7  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0425173 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>