15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_42613 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009042  PICST_42613  predicted protein  100 
 
 
453 aa  939    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07340  conserved hypothetical protein  28.26 
 
 
441 aa  85.5  0.000000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.656294  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57570  predicted protein  27.06 
 
 
611 aa  76.3  0.000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0322438  normal  0.127832 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46871  ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase small subunit N-methyltransferase I  23.51 
 
 
575 aa  67.8  0.0000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.139312  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48703  predicted protein  24.9 
 
 
344 aa  64.3  0.000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.790939  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48815  predicted protein  27.31 
 
 
519 aa  63.5  0.000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28212  predicted protein  27.05 
 
 
495 aa  55.5  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.19293 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34722  predicted protein  24 
 
 
524 aa  53.1  0.000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0720158  normal  0.0311419 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30738  predicted protein  25.64 
 
 
390 aa  51.6  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47621  predicted protein  21.65 
 
 
620 aa  50.8  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27063  predicted protein  22.3 
 
 
813 aa  50.4  0.00007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00530914  hitchhiker  0.0000354859 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40473  predicted protein  25 
 
 
488 aa  47  0.0007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_37749  predicted protein  29.35 
 
 
579 aa  45.1  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30906  predicted protein  27.5 
 
 
303 aa  45.1  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_18374  predicted protein  22.14 
 
 
375 aa  44.7  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.892854  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>